Institut Pasteur Rapport d'activité de l'unité Laboratoire d'analyse d'images quantitative

IP - CNRS URA 1947


Responsable : OLIVO-MARIN Jean-Christophe (jcolivo@pasteur.fr)

Résumé du rapport

Le Laboratoire d’Analyse d’Images Quantitative, qui a débuté son activité en septembre 1998, est spécialisé dans la recherche de méthodes d’analyse de l’information visuelle et de son traitement. Il conçoit, développe et met en œuvre des méthodes de traitement d'images dont le but est de permettre, en assurant la quantification de l’information, l’exploitation optimale des images produites dans le cadre de la recherche en biologie.

Abstract

The Quantitative Image Analysis Laboratory, which was set up in September 1998, is dedicated to developing the methodological framework for the automatic processing and analysis of visual information produced in the context of biological research. In the context of collaborations with biological groups, its goal is to promote and implement efficient visual information quantification of microscopy images.

Texte du rapport

Depuis sa création en septembre 1998, les activités du Laboratoire d’Analyse d’Images Quantitative sont dévolues en grande partie à l’équipement et à l’installation du laboratoire tant du point de vue des moyens matériels que de celui du personnel. En particulier, une grande attention a été consacrée au développement d’un ensemble de programmes de traitement d’images indépendant d’équipements spéciaux. Cette phase devrait être achevée dans le courant de l’année 1999 et permettra ainsi de mettre à la disposition des chercheurs du laboratoire une plate-forme logicielle performante et cohérente. Parallèlement à ces activités, la consolidation et l’achèvement de travaux et collaborations antérieurs avec des équipes de l’Institut Pasteur ont été réalisés. Ces collaborations s’inscrivaient dans la lignée de deux thèmes qui constituent les grands axes de l’activité de recherche du laboratoire et qui sont, d’une part, l’analyse du mouvement et de la forme et, d’autre part, le comptage et la caractérisation de spots. Ainsi, les méthodes mises au point ont été appliquées, dans le cadre de collaborations avec l’unité de Pathogénie Microbienne Moléculaire de P. Sansonetti, pour quantifier le mouvement et la pathogènécité de Entamoeba histolytica et pour étudier l’effet de l’interferon a sur la virulence de Shigella. Les nombreux contacts qui ont également été pris avec différentes unités du campus ont permis de lancer de nouveaux projets de collaborations et de définir les axes de recherche prioritaires pour l’année 1999.

Mots Clefs : traitement et analyse d’images de microscopie ; recalage d'images ; reconnaissance des formes ; poursuite du mouvement

Personnel de l'unité

Secrétariat de l'unité

DULIEU Isabelle, IP

Chercheurs de l'unité

OLIVO-MARIN Jean-Christophe, IP

Stagiaires de l'unité

MICHALET Xavier, Post-Doc

Publications de l'unité

UI: 99034590
UI: 98278962

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