Missions spécifiques
Objectifs et intérêt pour la santé publique
Dans le cadre des missions générales des Centres Nationaux de Référence (CNR), Le CNR des Escherichia coli et Shigella a été désigné par le Ministère en charge de la Santé et plus particulièrement par la Direction Générale de la Santé (DGS) pour assurer la surveillance microbiologique de maladies entériques transmissibles : dysenterie bacillaire, shigelloses, syndrome hémolytique et urémique, diarrhées dues aux E. coli entérohémorragiques, toxi-infections alimentaires collectives.
Le CNR des Escherichia coli et Shigella a été créé en avril 2002, il est associé au Laboratoire de Microbiologie de l’Hôpital Robert-Debré pour la surveillance des syndromes hémolytiques et urémiques grâce à un réseau de pédiatres-néphrologues.
Voir Missions générales des CNR
Le CNR des Escherichia coli et Shigella exerce la surveillance continue :
des Shigella :
- en sérotypant les souches d’origine humaine envoyées par les laboratoires correspondants (France métropolitaine et DOM-TOM)
- en suivant les tendances évolutives temporelles des différents sérotypes des Shigella,
- en détectant, avec la méthode appropriée, les shigelles des cas épidémiques afin de les différentier des cas non épidémiques, et en comparant les souches isolées chez les malades et dans d’autres sources en particulier alimentaire,
- en signalant à l’Institut de Veille Sanitaire les informations épidémiologiques essentielles sur chaque nouvelle souche du sérotype incriminé et les foyers de cas groupés notifiés au CNR.
des Escherichia coli entérohémorragiques et des SHU :
- en collaborant, avec le Laboratoire Associé, à la surveillance et l’alerte des Syndromes Hémolytiques et Urémiques (SHU) dûs aux Escherichia coli entérohémorragiques, et des infections à E. coli producteurs de Shiga-toxines (STEC) :
. par la recherche d’anticorps anti-LPS des E. coli entérohémorragiques dans le sérum de malades adultes et enfants (effectué au CNR des Escherichia coli et Shigella) ,
. par la détection par PCR des gènes présents chez les E. coli producteurs de Shiga-toxines à partir de selles et de souches chez les enfants (effectué au Laboratoire Associé) et chez les adultes (effectué au CNR des Escherichia coli et Shigella) : les gènes recherchés sont en priorité les gènes stx (Shiga-toxine ou vt = vérotoxine), eae codant "l’attachement et l’effacement" aux cellules épithéliales, ehlyA codant l’entérohémolysine,
. par le développement du sérotypage moléculaire O et H des souches de E. coli,
. par l’étude des souches par ribotypie ou pulsotypie (PFGE), ou la détermination du groupe phylogénétique des STEC.
- en signalant à l’Institut de Veille Sanitaire et à la Direction Générale de la Santé, tous les cas de SHU, mais également les résultats des analyses concernant les souches et les selles de malades,
- en participant à l’investigation de phénomènes épidémiques coordonnée par l’Institut de Veille Sanitaire : sérodiagnostic, typage de souches par sérotypie, comparaison de souches isolées chez les malades et dans d’autres sources,
- en contribuant avec l’Institut de Veille Sanitaire aux réseaux de surveillance européens: ENTER-NET et aux autres activités de surveillance européenne et internationale,
- en collaborant avec les autres structures en charge de la surveillance ou d’études ponctuelles sur les STEC, dans les aliments, chez l’animal et dans l’environnement avec échange et comparaison de souches.
