Changements taxonomiques

Principaux changements taxonomiques intervenus depuis 1996
Bactéries d'intérêt médical

Mise à jour du 09/12/2009
(Les ajouts 2008-2009 sont signalés par un)

Bacilles à Gram positif non sporulés

 

Actinobaculum massiliense Espèce nouvelle. Isolée d’une infection urinaire chronique. Synonyme : Actinobaculum massiliae J. Clin. Microbiol. 2002 ; 40 : 3938-3941.
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006 ; 56 : 2025–2027

 

Actinobaculum schaalii Genre nouveau, espèce nouvelle Int. J. Syst. Bacteriol. 1997 ; 47 : 899 – 903

 

Actinobaculum urinale Espèce nouvelle Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003 ; 53 : 679 – 682.

 

Actinomyces bernardiae Reclassé Arcanobacterium bernardiae Int. J. Syst. Bacteriol. 1997; 47 : 46 – 53

 

Actinomyces cardiffensis Espèce nouvelle. J. Clin. Microbiol. 2002 ; 40 : 3427 – 3431.
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003 ; 53 : 1 – 2

 

Actinomyces europaeus Espèce nouvelle, anaérobie facultatif. Petit bacille coryneforme. Int. J. Syst. Bacteriol. 1997 ; 47 : 687-692

 

Actinomyces graevenitzii Espèce nouvelle, anaérobie facultatif. Bacille droit, incurvé, quelques ramifications. Extrémités renflées. Colonies adhérentes à la gélose. Int. J. Syst. Bacteriol 1997 ; 47 : 885 - 888.

 

Actinomyces hongkongensis Espèce nouvelle, isolée d’une actinomycose pelvienne. System. Appl. Microbiol. 2003 ; 26 : 518-522. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54:307 (validation list).
Actinomyces johnsonii Espèce nouvelle (anciennement Actinomyces naeslundiii genospecies WVA 963). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 ; 59 : 509–516

Actinomyces massiliensis Espèce nouvelle. Isolée du sang. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 ; 59 : 540–544.

 

Actinomyces nasicola Espèce nouvelle, anaérobie facultatif. Bacille court, formes ramifiées, coccoïdes. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003 ; 53 : 1445 – 1448.

 

Actinomyces oricola Espèce nouvelle. Isolée d’abcès dentaires Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003; 53 : 1515-1518.

Actinomyces oris Espèce nouvelle (anciennement Actinomyces naelundii genospecies 2 ). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 ; 59 : 509–516

 

Actinomyces pyogenes Anciennement Corynebacterium pyogenes reclassé Arcanobacterium pyogenes. Int. J. Syst. Bacteriol. 1997; 47 : 46 – 53

 

Actinomyces suis Ancien Eubacterium suis reclassé Actinobaculumsuis nouveau genre, combinaison nouvelle Int. J. Syst. Bacteriol. 1997 ; 47 : 899-903

 

Anaerofustis stercorihominis Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolé de fèces. Anaerobe. 2004 ; 10 : 41 – 45. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54:1005 (validation list);

 

Anaerotruncus colihominis Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolé de fèces. Appartient au groupe Clostridiumleptum. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004 ; 54 : 413 – 417.

 

Anaerostipes caccae Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolé de fèces. Bacille Gram variable, non sporulé. Appartient au groupe Clostridium coccoides. System. Appl. Microbiol. 2002 ; 25 : 46 – 51. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52:1437 (Validation list).

Bifidobacterium infantis et Bifidobacterium suis sont unifiés sous le nom Bifidobacterium longum Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 1945 - 1951.

 

Bifidobacterium inopinatum Espèce nouvelle. (IJSB, 1996 ; 46 : 564) reclassée Scardovia inopinata, genre nouveau, combinaison nouvelle. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 809 – 812.

 

Bifidobacterium denticolens Espèce nouvelle. (IJSB, 1996 ; 46 : 564) reclassée Parascardovia denticolens, genre nouveau, combinaison nouvelle. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 809 – 812.

 

Bifidobacterium scardovii Espèce nouvelle. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 995 – 999.

 

Bulleidia extructa Genre nouveau, espèce nouvelle. Apparenté au genre Eubacterium. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000 ; 50 : 979 – 983.

 

Catenibacterium mitsuokai Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolé de fèces. Apparenté au genre Eubacterium. Ressemble à Lactobacillus vitulinus. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000 ; 50 : 1595 – 1599.

 

Collinsella intestinalis Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolé de fèces. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000 ; 50 : 1767 – 1774.

 

Collinsella stercoris Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolé de fèces. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000 ; 50 : 1767 – 1774.

 

Coprobacillus cateniformis Genre nouveau, espèce nouvelle. Apparenté au genre Eubacterium. Isolé de fèces. Microbiol. Immunol 2000 ; 44 : 23 – 28. Int. J. Syst. Bacteriol. 50:949 (validation list).

 

Cryptobacterium curtum Genre nouveau, espèce nouvelle. Apparenté aux Eubacterium non glucidolytiques. Int. J. Syst. Bacteriol. 1999 ; 49 : 1193-1200. et 1952.

 

Dorea longicatena Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolé de fèces. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 423 – 428.

 

Eggerthella hongkongensis Espèce nouvelle, phénotypiquement très proche de E. lenta Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2004 ; 49 : 255-263.

 

Eggerthella sinensis Espèce nouvelle, phénotypiquement très proche de E. lenta Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2004 ; 49 : 255-263.

 

Eubacterium aerofaciens Reclassé Collinsella aerofaciens, genre nouveau, combinaison nouvelle Int. J. Syst. Bacteriol 1999 ; 49 : 557 – 565.

 

Eubacterium alactolyticum Reclassé Pseudoramibacter alactolyticus, genre nouveau, combinaison nouvelle. Int J. Syst. Bacteriol 1996 ; 46 : 1083 – 1087.

 

Eubacterium exiguum Espèce nouvelle (IJSB 1996 ; 46 : 1120), reclassée Slackia exigua, genre nouveau, combinaison nouvelle, apparentée à E. lenta, sensible à la bile. Int. J. Syst. Bacteriol 1999 ; 49 : 595 – 600.

 

Eubacterium formicigenerans Reclassé Dorea formicigenerans, genre nouveau, combinaison nouvelle. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 423 – 428.

 

Eubacterium fossor Reclassé Atopobium fossor, genre nouveau, combinaison nouvelle. Microbiol. Immunol. 1999 ; 43 : 389 – 395. Int. J. Syst. Bacteriol. 49:1325 (validation list).

 

Eubacterium infirmum Espèce nouvelle, produit de l’acide butyrique. Int. J. Syst. Bacteriol 1996 ; 46 : 957 – 959.

 

Eubacterium lentum Reclassé Eggerthella lenta, genre nouveau, combinaison nouvelle. Int. J. Syst. Bacteriol .1999 ; 49 : 595 – 600.

 

Eubacterium minutum Espèce nouvelle ( IJSB, 1996; 46: 31), synonyme de Eubacterium tardum Int. J. Syst. Bacteriol. 1999 49: 1939 – 1941.

 

Eubacterium tardum Espèce nouvelle, produit de l’acide butyrique. Reclassée Eubacterium minutum Int. J. Syst. Bacteriol 1996 ; 46 : 957 – 959.

 

Eubacterium timidum Reclassé Mogibacterium timidum, genre nouveau, combinaison nouvelle. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000 ; 50 : 679 – 688.

 

Holdemania filiformis Genre nouveau, espèce nouvelle, voisin du genre Solobacterium. Int. J. Syst. Bacteriol 1997 ; 47 : 1201 – 1204.

 

Mogibacterium diversum Nouvelle espèce, ne peut pas être distinguée des autres espèces du genre Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 115 – 122.

 

Mogibacterium neglectum Nouvelle espèce, ne peut pas être distinguée des autres espèces du genre Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 115 – 122.

 

Mogibacterium pumilum Genre nouveau, espèce nouvelle. Phénotypiquement identique à Mogibacteriumtimidum Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000 ; 50 : 679 – 688.

 

Mogibacterium vescum Genre nouveau, espèce nouvelle. Phénotypiquement identique à Mogibacteriumtimidum Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000 ; 50 : 679 – 688.

 

Moryella indoligenes Genre nouveau, espèce nouvelle. Appartient phylogénétiquement au groupe Clostridium coccoides. Int. J. Syst. Evol. Microbiol 2007; 57: 725 – 729.

 

Lactobacillus uli Reclassé Olsenella uli. Genre nouveau, combinaison nouvelle. Appartient à la famille des Corobacteriaceae. Isolé de la cavité buccale Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1797 – 1804.

 

Olsonella profusa Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolé de la cavité buccale. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1797 – 1804

 

Oribacterium sinus Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolé d’un pus de sinus. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004 ; 54 : 1611 – 1615.

Propionibacterium acidifaciens Espèce nouvelle. Isolé de la cavité buccale. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 ; 59 : 2778-2781.

 

Propionibacterium lymphophilum Reclassé Propionimicrobium lymphophilum genre nouveau, combinaison nouvelle. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 1925 – 1927.

 

Turicibacter sanguinis Genre nouveau, espèce nouvelle. Hémoculture. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 1263 – 1266.

 

Roseburia intestinalis Espèce nouvelle, isolée de fèces. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 1615 – 1620.

 

Shuttleworthia satelles Genre nouveau, espèce nouvelle, apparenté aux Eubacterium glucidolytiques. Isolé de la cavité buccale. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 1469 – 1475.

Slackia isoflavoniconvertens Espèce nouvelle. Isolé de fèces. Appl. Environ. Microbiol. 2009 ; 75 : 1740–1744

 

Solobacterium moorei Genre nouveau, espèce nouvelle, apparenté aux Eubacterium glucidolytiques. Isolé de fèces. Microbiol. Immunol 2000 ; 44 : 223 – 227.
Int. J. Syst. Bacteriol. 50:1415 (validation list).

 

Varibaculum cambriensis (sic) Genre nouveau, espèce nouvelle. Apparenté phylogénétiquement aux genres Actinomyces, Actinobaculum, Arcanobacterium, et Mobiluncus. J Clin Microbiol. 2003 ; 41: 640-644.
Int. J. Syst. Bacteriol. 2003 ; 53:627 (validation list). Varibaculum cambriense

Bacilles à Gram positif sporulés

CLOSTRIDIUM

 

Clostridium absonum

Nom rejeté. Synonyme de Clostridiumsardiniense

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005 ; 55 : 1193 – 1197.

 

Clostridium aldenense

Espèce nouvelle. Phylogénétiquement voisine de C. clostridioforme et C. bolteae.

J. Clin. Microbiol. 2006 ; 44 : 2416 – 2422.

 

Clostridium asparagiforme

Espèce nouvelle, isolée de fèces. Phylogénétiquement voisine de C. clostridioforme et C. bolteae.

Syst. Appl. Microbiol. 2006 ; 29 : 292 – 299.

 

Clostridium barkeri

Reclassé Eubacterium barkeri, combinaison nouvelle

Int. J. Syst. Bacteriol 1994 ; 44 : 812 – 826.

 

Clostridium bartlettii

Espèce nouvelle, isolée de fèces. Phylogénétiquement voisine de C.glycolicum.

Anaerobe 2004 ; 10 : 179 – 184.

 

Clostridium bolteae

Espèce nouvelle, Phylogénétiquement voisine de C.clostridioforme.

Syst. Appl. Microbiol. 2003 ; 26 : 84 – 89.

 

Clostridium citroniae

Espèce nouvelle. Phylogénétiquement voisine de C. clostridioforme et C. bolteae.

J. Clin. Microbiol. 2006 ; 44 : 2416 – 2422.

Clostridium coccoides

Reclasséé Blautia coccoides.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 1896-1902

 

Clostridium hathewayi

Espèce nouvelle, isolée de fèces, voisine de C.clostridioforme.

Syst. Appl. Microbiol. 2001 ; 24 :353 – 357.
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003 ; 5 : 935 – 937.

 

Clostridium hiranonis

Espèce nouvelle, isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 39 – 44.

 

Clostridium hylemonae

Espèce nouvelle, isolée de fèces.

Int. J. Syst. Bacteriol. 2000 ; 50 : 971 – 978.

Clostridium lavalense

Espèce nouvelle, isolée de fèces. Résistant aux glycopeptides. Phylogénétiquement proche de C. asparagiforme, de C. boltae et de C. clostridioforme

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 ; 59 : 498-503.

 

Clostridium putrificum

Nom rejeté

Int. J. Syst. Bacteriol. 1999 ; 49 : 339 – Opinion 69.

 

Clostridium hastiforme

Nom rejeté. Synonyme de Tissierella praeacuta

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004 ; 54: 947-949


Autres bacilles à Gram positif sporulés

Blautia coccoides

Nouvelle combinaison (anciennement Clostridium coccoides)

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 1896-1902

Robinsoniella peoriensis

Genre nouveau, espèce nouvelle. Bacillle sporulé isolé d’une plaie profonde au talon et également de l’environnement (fumier de porc). Phylum Firmicutes, famille des Lachnospiraceae.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 ; 59 : 150-155.


Bacilles à Gram négatif

 

Akkermansia muciniphila

Genre nouveau, espèce nouvelle. Origine intestinale. Dégrade la mucine.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004 ; 54 : 1469 – 1476.

Alistipes finegoldii

Genre nouveau, espèce nouvelle.

System. Appl. Microbiol. 2003 ; 26 : 182 – 188.
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003 ; 53 : 1701 (Validation list).

 

Alistipes onderdonkii

Espèce nouvelle, produit un pigment sur sang laqué de lapin. Résistant à la bile.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. 56 : 1985 – 1990.

 

Alistipes shahii

Espèce nouvelle, produit un pigment sur sang laqué de lapin. Résistant à la bile.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. 56 : 1985 – 1990.

 

Anaerorhabdus furcosus

Ancien Bacteroidesfurcosus, nom corrigé : Anaerorhabdus furcosa

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000 ; 50 : 1691.

 

Bacteroides cellulosilyticus

Espèce nouvelle. Isolée de fèces. Dégrade la cellulose. Phylogénétiquement proche de Bacteroidesintestinalis.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007; 57: 1516-1520.

 

Bacteroides coprocola

Espèce nouvelle. Proche de B. massiliensis et B. vulgatus. Isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005 ; 55 : 2143 – 2147.

 

Bacteroides coprophilus

Espèce nouvelle. Isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007; 57: 1323-1326.

 

Bacteroides distasonis

Reclassé Parabacteroides distasonis. Nouveau genre, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. 56 : 1599 – 1605.

 

Bacteroides dorei

Espèce nouvelle. Phylogénétiquement et phénotypiquement proche de B. vulgatus.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006 ; 56 : 1639 – 1643.

 

Bacteroides finegoldii

Espèce nouvelle. Proche de B. thetaiotaomicron et de B. ovatus. Indole négatif. Isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006 ; 56 : 931 – 935.

 

Bacteroides forsythus

Reclassé Tannerella forsythensis. Proposition de renommer l’épithète en « forsythia »

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 841 – 849 Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003, 53 : 2111 – 2112.

 

Bacteroides goldsteinii

Espèce nouvelle. Proche de B. merdae et B. distasonis. Indole négatif. Origine intestinale. Ces deux espèces ont été reclassées dans un nouveau genre : Parabacteroides.
B . golsteinii est reclassée Parabacteroidesgoldsteinii.

J. Clin. Microbiol. 2005 ; 43 :4522 – 4527.
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. 56 : 1599 – 1605.

 

Bacteroides intestinalis

Espèce nouvelle. Phylogénétiquement proche de B. uniformis.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. 56 : 151 – 154.

 

Bacteroides massiliensis

Espèce nouvelle. Proche de B. vulgatus. Isolée d’une hémoculture chez un nouveau-né.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005 ; 55 : 1335 – 1337.

 

Bacteroides merdae

Reclassée Parabacteroides merdae. Nouveau genre, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. 56 : 1599 – 1605.

 

Bacteroides nordii

Espèce nouvelle. Indole +. Origine intestinale.

J. Clin. Microbiol. 2004 ; 42 : 5565 – 5570.
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 20 05 ; 55 : 983 – 985 (Validation list).

 

Bacteroides plebeius

Espèce nouvelle. Proche de B. massiliensis et B. vulgatus. Isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005 ; 55 : 2143 – 2147.

 

Bacteroides putredinis

Reclassé Alistipes putredinis. Genre nouveau, combinaison nouvelle.

System. Appl. Microbiol. 2003 ; 26 : 182 – 188.
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003 ; 53 : 1701 (Validation list).

 

Bacteroides salyersae

Espèce nouvelle. Indole +. Origine intestinale.

J. Clin. Microbiol. 2004 ; 42 : 5565 – 5570.
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 20 05 ; 55 : 983 – 985 (Validation list).

Bacteroides splanchnicus

Reclassé dans un nouveau genre : Odoribacter. Odoribacter splanchnicus. Nouvelle combinaison.

Int J Syst Evol Microbiol 2008; 58 : 103 -109.

Barnesiella intestinihominis

Espèce nouvelle – isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 2716-2720.

 

Brachyspira

Unification des genres Brachyspira et Serpulina

Microbiol. Immunol.1997 ; 41 : 445 – 452.
Int. J. Syst. Bacteriol. 33:896 (validation list).

 

Brachyspira intermedia

Brachyspira murdochii

Les espèces Serpulina intermedia et Serpulina murdochii sont reclassées dans le genre Brachyspira.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006 ; 56 : 1009 – 1012.

 

Campylobacter hominis

Espèce nouvelle

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001; 51: 651 – 660

Capnocytophaga leadbetteri

Espèce nouvelle

Int J Syst Evol Microbiol 2008; 58 : 324–336.

Capnocytophaga genospecies AHN8471

Espèce nouvelle. Non distinguable de C. ochracea et C. sputigena par les tests phénotypiques conventionnels.

Int J Syst Evol Microbiol 2008; 58 : 324–336.

 

Cetobacterium somerae

Espèce nouvelle, isolée de fèces. Isolée également à partir de la flore intestinale de poissons d’eau douce. Microaérotolérant, catalase négative, indole positif. Sensible au métronidazole.

Syst. Appl. Microbiol. 2003 ; 26 : 177-181.
Letters in Applied Microbiology. Online 17 oct. 2007. doi: 10.1111/j.1472-765X.2007.02258.x

 

Desulfomicrobium orale

Espèce nouvelle

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001; 51: 1035 – 1044.

 

Desulfomonas pigra

Reclassé Desulfovibrio piger, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 1305 – 1308.

 

Dialister invisus

Espèce nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003 ; 53 : 1937 – 1940.

 

Dialister micraerophilus

Espèce nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005 ; 55 : 2471-2478.

 

Dialister propionicifaciens

Espèce nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005 ; 55 : 2471-2478.

Dialister succinatiphilus

Espèce nouvelle – isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 2716-2720..

 

Dysgonomonas capnocytophagoides

Genre nouveau, espèce nouvelle. Relié phylogénétiquement aux genres Bacteroides, Porphyromonas, et Prevotella. Anaérobie facultatif.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000 ; 50 : 2189 – 2195.

 

Dysgonomonas gadei

Genre nouveau, espèce nouvelle. Relié phylogénétiquement aux genres Bacteroides, Porphyromonas, et Prevotella. Anaérobie facultatif. Vésicule biliaire infectée.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000 ; 50 : 2189 – 2195.

 

Dysgonomonas mossii

Genre nouveau, espèce nouvelle. Anaérobie facultatif.

Syst. Appl. Microbiol. 2002 ; 25 : 194-197.
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002; 52: 1915-1916

 

Falcivibrio grandis

transféré dans le genre Mobiluncus. Est synonyme de M. mulieris.

Syst. Appl. Microbiol. 2004 ; 27 : 72 - 83. Int J Syst Evol Microbiol. 2005 ; 55: 7-8.

 

Falcivibrio vaginalis

transféré dans le genre Mobiluncus. Est synonyme de M. curtisii.

Syst. Appl. Microbiol. 2004 ; 27 : 72 - 83. Int J Syst Evol Microbiol. 2005 ; 55: 7-8.

 

Fusobacterium alocis

Reclassé Filifactor alocis, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Bacteriol. 1999 ; 49 : 1375 – 1379

 

Fusobacterium sulci

Reclassé Eubacterium sulci, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Bacteriol. 1999 ; 49 : 1375 – 1379

 

Fusobacterium prausnitzii

Reclassé Faecalibacterium prausnitzii, genre nouveau, combinaison nouvelle

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 2141 – 2146.

 

Jonquetella anthropi

Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolée dans diverses pathologies humaines. Culture difficile.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007 ; 57 : 2743-2748.

 

Leptotrichia trevisanii

Espèce nouvelle, catalase positive, aérotolérant.

Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2001 ; 20 : 765 – 769.
Int. J. Syst. Bacteriol. 52: 686 (validation list).

 

‘Leptotrichia amnionii’

Nom non validé. Espèce nouvelle, morphologie coccobacillaire ou fusiforme. Proche de Sneathia sanguinegens.

J.Clin. Microbiol. 2002 ; 40 : 3346 – 3349.

 

Leptotrichia goodfellowii
Leptotrichia hofstadii Leptotrichia shahii Leptotrichia wadeii

Espèces nouvelles.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004 ; 54 : 583 – 592.

Megamonas funiformis

Espèce nouvelle proche de Megamonas hypermegale. Isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 970-975.

 

Megamonas hypermegas

Anciennement Bacteroides hypermegas renommé Megamonas hypermegale

Int. J. Syst. Bacteriol. 1998 ; 48 : 1073-1074

 

Parabacteroides

Genre nouveau. Comporte les anciens Bacteroidesdistasonis, Bacteroidesgoldsteinii, Bacteroidesmerdae

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. 56 : 1599 – 1605.

Parabacteroides gordonii

Espèce nouvelle. Isolée de sang.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 ; 59 : 2843-2847.

 

Parabacteroides johnsonii

Espèce nouvelle. Diffère de P. merdae par la fermentation de l’arabinose et du rhamnose

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007. 57 : 293 – 296.

Paraprevotella clara

Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009. 59 : 1895 - 1900.

Paraprevotella xylaniphila

Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009. 59 : 1895 – 1900.

Phoceaicola abscessus

Espèce nouvelle. Isolée d’un abcès cérébral.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 ; 59 : 2232–2237

Porphyromonas bennonis

Espèce nouvelle. Isolée de plaies et d’abcès.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009. 59 : 1727-1732.

 

Porphyromonas uenonis

Espèce nouvelle. Phénotypiquement apparentée à
P
. endodontalis.

J. Clin. Microbiol. 2004; 42: 5298 –5301

 

Porphyromonas somerae

Espèce nouvelle d’origine humaine. Phénotypiquement apparentée à Porphyromonaslevii.

J. Clin. Microbiol. 2005 ; 43 : 4455 – 4459

Prevotella amnii

Espèce nouvelle. Isolée de liquide amniotique. Proche de Prevotellabivia.

Int J Syst Evol Microbiol 2008; 58 : 89 – 92

 

Prevotella baroniae

Espèce nouvelle. Non pigmentée, saccharolytique. Cavité buccale.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005; 55 : 1551-1555.

 

Prevotella bergensis

Espèce nouvelle. Non pigmentée

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006; 56 : 609 - 612.

 

Prevotella copri

Espèce nouvelle. Isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007 ; 57 : 941 – 946.

Prevotella histicola

Espèce nouvelle isolée de la cavité buccale. Proche de P. melaninogenica et P. veroralis. Pigmentation variable.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 1788-1791.

 

Prevotella maculosa

Espèce nouvelle isolée de la cavité buccale. Proche de P. oris et P. salivae. Ne produit pas de pigment.

Int J Syst Evol Microbiol 2007; 57: 2936-2939.

 

Prevotella marshii

Espèce nouvelle. Non pigmentée, saccharolytique. Cavité buccale.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005; 55 : 1551-1555.

 

Prevotella massiliensis

Espèce nouvelle.

Res. Microbiol. 2005 ; 156 :967 – 973

Prevotella micans

Espèce nouvelle isolée de la cavité buccale.

Int J Syst Evol Microbiol. 2009 ; 59 : 771-774.

 

Prevotella multiformis

Espèce nouvelle, non pigmentée.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005; 55 : 815-819.

 

Prevotella multisacharivorax

Espèce nouvelle. Non pigmentée, saccharolytique. Cavité buccale.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005; 55 : 1839-1843.

 

Prevotella nanceiensis

Espèce nouvelle. Non pigmentée.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007; 57 : 2216 – 2220.

 

Prevotella pallens

Espèce nouvelle, produit une pigmentation faible.

Int. J. Syst. Bacteriol. 1998 ; 48 : 47 – 51.

 

Prevotella pleuritidis

Espèce nouvelle. Phénotypiquement similaire à P. enoeca.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007; 57 : 1725 – 1756.

 

Prevotella salivae

Espèce nouvelle, ne produit pas de pigment.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004 ; 54: 877-883.

 

Prevotella shahii

Espèce nouvelle, ne produit pas de pigment.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004 ; 54: 877-883.

 

Prevotella stercorea

Espèce nouvelle. Isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007 ; 57 : 941 – 946.

 

Prevotella timonensis

Espèce nouvelle, ne produit pas de pigment.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007 ; 57: 883 - 886.

 

Sneathia sanguinegens

Voir ‘Leptotrichia amnionii’

Syst. Appl Microbiol. 2001 ; 24 :358 – 361. Int. J. Syst. Bacteriol. 52:687 (validation list).

Sutterella parvirubra

Espèce nouvelle, isolée de fèces.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 970-975.

 

Sutterella wadsworthensis

Genre nouveau, espèce nouvelle, microaérophile, résistante à la bile, apparentée à Campylobacter gracilis.

Int. J. Syst. Bacteriol. 1996 ; 46 : 252 – 258

Synergistetes
Synergistia
Synergistales
Synergistaceae

Nouveau phylum
Nouvelle classe
Nouvel ordre
Nouvelle famille
Note : Le genre Jonquetella décrit en 2007 (voir plus haut) appartient à ce nouveau phylum.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 ; 59 : 1028-1035

 

Victivallis vadensis

Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolée de fèces. Dégrade le cellobiose.

Int J Syst Evol Microbiol 2003 53: 211-215


Cocci à Gram positif

 

Anaerococcus murdochii

Espèce nouvelle.

J. Clin. Microbiol. 2007 ; 45 : 1746 - 1752

Blautia hansenii

Nouvelle combinaison (anciennement Ruminococcus hansenii)

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 1896-1902

Blautia hydrogenotrophica

Nouvelle combinaison (anciennement Ruminococcus hydrogenotrophicus)

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 1896-1902

Blautia luti

Nouvelle combinaison (anciennement Ruminococcus luti)

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 1896-1902

Blautia producta

Nouvelle combinaison (anciennement Ruminococcus productus)

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 1896-1902

Blautia schinckii

Nouvelle combinaison (anciennement Ruminococcus

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 1896-1902

 

Fastidiosipila sanguinis

Genre nouveau, espèce nouvelle. Cultive en présence de 2 et 6% d’oxygène. Asaccharolytique. produit les acides acétique et butyrique.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005 ; 55 : 853 – 858.

 

Parvimonas

Genre nouveau. Remplace le genre Micromonas. Nom illégitime. Déjà attribué à une algue.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006 ; 56 : 2711 – 2713.

 

Peptoniphilus gorbachii

Espèce nouvelle.

J. Clin. Microbiol. 2007 ; 45 : 1746 - 1752

 

Peptoniphilus olsenii

Espèce nouvelle.

J. Clin. Microbiol. 2007 ; 45 : 1746 - 1752

 

Peptostreptococcus asaccharolyticus

Reclassée Peptoniphilus asaccharolyticus genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus barnesae

Reclassé Gallicola barnesae, genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus harei

Espèce nouvelle (IJSB, 1997 ; 47 : 781), reclassée Peptoniphilus harei, genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus heliotrinreducens

Reclassée Slackia heliotrinireducens genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Bacteriol 1999 ; 49 : 595 – 600.

 

Peptostreptococcus hydrogenalis

Espèce nouvelle (IJSB, 1990 ; 40 : 305), reclassée Anaerococcus hydrogenalis, genre nouveau, combinaison nouvelle

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus indolicus

Reclassée Peptoniphilus indolicus. Genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus ivorii

Espèce nouvelle (IJSB, 1997 ; 47 : 781) reclassée Peptoniphilus ivorii genre nouveau,.combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus lacrimalis

Espèce nouvelle (IJSB, 1992 ; 42 : 602), reclassée Peptoniphilus lacrimalis, genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus lactolyticus

Espèce nouvelle (IJSB, 1992 ; 42 : 602), reclassée Anaerococcuslactolyticus, genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus magnus

Reclassée Finegoldia magna, genre nouveau, combinaison nouvelle.

Anaerobe 1999 ; 5 : 555 – 559.
Int. J. Syst. Bacteriol. 2000 ; 50:1415 – 1417 (validation list).

 

Peptostreptococcus micros

Reclassée Micromonasmicros, genre nouveau, combinaison nouvelle.
Reclassé Parvimonasmicra. Nouveau genre, combinaison nouvelle.

Anaerobe 1999 ; 5 : 555 – 559.
Int. J. Syst. Bacteriol. 2000 ; 50:1415 – 1417 (validation list).
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006 ; 56 : 2711 – 2713.

 

Peptostreptococcus octavius

Espèce nouvelle (IJSB, 1997 ; 47 : 781) reclassée Anaerococcus octavius, genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus prevotii

Reclassée Anaerococcusprevotii, genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus productus

Reclassée Ruminococcus productus puis Blautia producta, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Bacteriol 1994 ; 44 : 87 – 93.

 

Peptostreptococcus stomatis

Espèce nouvelle. Ressemble à Peptostreptococcusanaerobius. Isolée de la cavité buccale.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006 ; 56 : 751 – 754.

 

Peptostreptococcus tetradius

Reclassée Anaerococcustetradius, genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

 

Peptostreptococcus vaginalis

Espèce nouvelle (IJSB, 1992 ; 42 : 602), reclassée Anaerococcusvaginalis, genre nouveau, combinaison nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001 ; 51 : 1521 – 1528.

Ruminococcus gauvreauii

Espèce nouvelle isolée de fèces – résistante aux glycopeptides.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 1393-1397.


Cocci à Gram négatif

 

Acidaminococcus intestini

Espèce nouvelle

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007; 57: 2314 – 2319.

 

Anaeroglobus geminatus

Genre nouveau, espèce nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002 ; 52 : 983 – 986.

 

Megasphaera micronuciformis

Espèce nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003 ; 53 : 547 – 553.

Negativicoccus succinicivorans

Genre nouveau, espèce nouvelle. Isolée d’échantillons cliniques.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. Published August 10, 2009 as doi:10.1099/ijs.0.013102-0

 

Veillonella denticariosi

Espèce nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007; 57: 2844-2848.

 

Veillonella montpellierensis

Espèce nouvelle.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004 ; 54: 1311-1316.

Veillonella rogosae

Espèce nouvelle. Isolée de plaque dentaire.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008 ; 58 : 581–584