Activités de service


Expertises

Recueil ou traitement des diagnostics (sérologie, bactériologie et amplification génique - PCR) de la leptospirose humaine sur le territoire métropolitain, et recueil des données épidémiologiques.

Le diagnostic sérologique : le CNR contribue, à la demande des laboratoires de biologie clinique, à l’élaboration d’une grande partie des diagnostics épidémiologiquement pertinents.
Technique utilisée : test de microagglutination (MAT), nécessitant l’emploi de seize antigènes vivants (24 antigènes sont utilisés par le CNR), la lecture s’effectuant au microscope à fond noir.

Typage des souches de leptospires : tous les isolements adressés au CNR sont caractérisés au niveau de l’espèce, du sérogroupe et, si possible, du sérovar.
Techniques utilisées :
- Sérotypage : Détermination du sérogroupe à l’aide d’immunsérums de lapins représentatifs des principaux sérogroupes.
- Typages moléculaires : Electrophorèse en champ pulsé, séquençage partiel du gène codant l’ARN 16S, MLVA (Multi Locus VNTR Analysis) et MLST (Multi Locus Sequence Typing).

Formation aux techniques de laboratoire applicables à la leptospirose et transfert technologique.

Développement et évaluation de nouvelles méthodes de diagnostic et de typage.

Conservation, enrichissement et envoi aux laboratoires qui en feront la demande, des souches types de leptospira et des antisérums spécifiques.

Collection de souches

Leptospires : l’Unité de Biologie des Spirochètes qui héberge le CNR entretient sa propre collection de souches. Cette collection comprend plus de 1200 souches réparties en souches de référence, souches isolées de produits biologiques humains (environ 500), animales (environ 500) ou environnementales (environ 100).

Surveillance épidémiologique

Après recueil puis enregistrement, les données cliniques et épidémiologiques enrichies des résultats des techniques de référence pratiquées au laboratoire, sont analysées. Le résultat de ces analyses ainsi que toutes informations d’ordre épidémiologique, technique, scientifique ou bibliographique, sont transmis à la DGS et à l’InVS, ainsi qu’aux microbiologistes correspondants.
Ils sont également disponibles à partir des résumés des rapports d’activités.

Recherche impliquant le CNR et le CCOMS

L’introduction de nouvelles méthodes dans les activités du CNR et du CCOMS résulte de l’application pratique des thèmes de l’Unité de Recherche qui les abrite. La plupart des développements des méthodes moléculaires citées ci-dessus tant pour le typage (MLVA, Electrophorèse en champ pulsé, etc) que pour le diagnostic (PCR) ont été initiés dans l’Unité.

Voir le rapport annuel de recherche de l’Unité (page actualités-rapports)

Collaborations et réseaux

Nationales
En particulier avec les laboratoires qui pratiquent la MAT, avec les structures vétérinaires, ainsi que les structures de santé publique des DOM-TOM pour des actions de formation, de contrôle externe et d’échange de données.

Avec le réseau international des Instituts Pasteur et Instituts associés
Le réseau offre des structures favorables au transfert technologique dans les lieux où la leptospirose est endémique. Le transfert a a été effectué en Nouvelle Calédonie, à Madagascar. au Cambodge, etc).

Internationales
Les collaborations avec les laboratoires spécialisés sont nombreuses (Amsterdam, Salvador de Bahia, Sassari etc).

Le Laboratoire de la Leptospirose participe :
- au réseau mondial des Centres Collaborateurs de l’O.M.S (CCOMS) qui sont au nombre de 5. Dans le cadre de son mandat de Centre Collaborateur FAO-OMS (CCOMS), il fait partie des CCOMS accrédités pour l’identification de nouveaux sérovars. Il participe aussi à l’initiative de l’OMS pour l’évaluation de la charge globale de la leptospirose (http://www.who.int/zoonoses/diseases/lerg/en/)
- à l’International Leptospirosis Society (ILS), coordonnée par la Hollande, dont le siège est en Australie.
- au Subcommittee on the taxonomy of Leptospira (sous l’égide de l’ International Committee on Systematic Bacteriology qui comprend 10 membres (dont le Dr Mathieu Picardeau).

Assurance qualité

Le CNR est engagé dans une démarche qualité, s’inscrivant dans le cadre de la politique qualité de l’Institut Pasteur.