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Activités de service

Expertises (diagnostic)

En France métropolitaine, le CNR contribue au diagnostic des fièvres hémorragiques virales (FHV) pour lesquelles il n’existe pas de kits de diagnostic commercialisés ou pour lesquelles un laboratoire de haute sécurité de type P3 ou P4 est requis.

Le diagnostic sérologique de la FHSR est assuré par des laboratoires d’analyses ou hospitaliers. Le CNR intervient pour la confirmation systématique de tous les cas positifs ou douteux. Il collecte les informations épidémiologiques de la FHSR en France.

Il peut intervenir directement dans le cas d’investigations particulières d’infections à hantavirus notamment celles à syndrome pulmonaire (HPS).

Attention : avant tout envoi d’échantillon vers les CNR lire attentivement le chapitre "Informations pratiques" afin d’appliquer la procédure spécifique à ces agents. 
En effet :

1. compte tenu du grand nombre et de la diversité de répartition géographique des virus responsables de FHV, il est impératif pour le CNR de disposer de renseignements cliniques et épidémiologiques afin d’orienter au mieux le diagnostic étiologique.

2. les échantillons biologiques, envoyés pour le diagnostic de FHV, doivent être emballés et acheminés conformément à la réglementation prévue pour le transport des matières infectieuses.

Techniques mises en oeuvre :

- Identification virale : Mise en évidence et caractérisation du génome par amplification génique (RT-PCR) et séquençage, mise en évidence d’antigène viral et isolement du virus sur cultures cellulaires.

- Sérologie : principalement ELISA avec mise en évidence d’anticorps IgG et IgM spécifiques, immunofluorescence indirecte et séroneutralisation.

Le délai d’exécution, variable selon les cas, est de quelques heures à 1 semaine.

Surveillance épidémiologique et alerte

Viroses endémiques

Le CNR, en France, participe à la surveillance des FHV endémiques, en relation avec l’InVS (Institut national de Veille Sanitaire) et la DGS (Direction Générale de la Santé).

- La fièvre hémorragique à syndrome rénal (FHSR) du groupe Hantavirus
Causée par le virus Puumala, elle est endémique dans le quart Nord-Est de la France. Le campagnol roussâtre est le réservoir du virus et la transmission se fait par inhalation de poussières infectées par l’urine ou les excréments de ces rongeurs (manipulation de bois, nettoyage de greniers…).

Voir les rapports d’activité au chapitre "Actualités - Rapports"

Viroses d’importation

Le CNR participe à la surveillance des maladies virales émergentes à l’échelon européen et international.

Voir paragraphe "Collaborations et réseaux"

Autres expertises, collection de souches

Dans le cadre du CNR :

Constitution et entretien d’une souchothèque représentant une cinquantaine d’espèces virales de différentes familles (Bunyavirus, Hantavirus, Nairovirus, Phlebovirus, Arenavirus, Filovirus, Flavivirus, Henipavirus...)

Dans le cadre du Centre Collaborateur OMS :

Expertises demandées par différents pays suite à des épisodes épidémiques.
Par exemple : Guinée en 2000, Côte d’Ivoire en 2001, Soudan en 2002 et 2005, Mali 2005, réponse à l’épidémie de fièvre hémorragique à virus Ebola au Gabon et au Congo (décembre 2001-janvier 2002).

Formation, transfert de connaissances

- Une brochure de sensibilisation intitulée "La Fièvre hémorragique avec syndrome rénal en France" a été réalisée en collaboration avec les différents partenaires intervenant dans la surveillance et éditée par le Secrétariat d’Etat à la Santé et à l’Action Sociale, SICOM n°99130/2 et reprise dans le Bulletin Epidémiologique Hebdomadaire 1999, 33: 137-139. (BEH n°99/33)

- Maintien et diffusion de matériel biologique de référence,

- Mise au point, évaluation et diffusion de techniques de diagnostic,

- Enseignements,

- Formation de stagiaires étrangers (Europe, Afrique, Asie).

Principaux thèmes de recherche

Les recherches menées par le CNR en collaboration avec plusieurs partenaires extérieurs, sont liées en partie à celles de l’Unité de Biologie des Infections Virales Emergentes (UBIVE) .

La fièvre hémorragique à syndrome rénal :

- surveillance épidémiologique
- amélioration du diagnostic (protéines recombinantes...)
- épidémiologie moléculaire
- étude du réservoir rongeurs et détermination de facteurs prédictifs d’épidémisation

les fièvres hémorragiques africaines :

- physiopathologie de la fièvre hémorragique à virus Lassa
- évaluation d’antiviraux actifs sur les virus de classe 4
- recherche du réservoir du virus Ebola

Pour plus de détails voir le rapport d’activité de l’Unité de Biologie des Infections Virales Emergentes

Collaborations et réseaux

Le CNR fait partie du Réseau Européen des Maladies Virales d’Importation (ENIVD). Ce réseau regroupe des laboratoires spécialisés de 27 pays européens. Les objectifs de ce réseau sont de surveiller l’introduction et la circulation de ces virus en Europe, de définir les conduites à tenir en cas d’importation de ces virus, d’échanger réactifs et matériel biologique et de standardiser les techniques de diagnostic.

Dans le cadre du Réseau International des Instituts Pasteur
Le CNR est membre actif du Réseau International des Instituts Pasteur et Instituts Associés. A ce titre, il effectue notamment :

- l’étude épidémiologique des Hantavirus dans différents pays (Cambodge, Vietnam, Madagascar),
- l’étude épidémiologique du virus Nipah en Asie du Sud-Est (Cambodge, Vietnam).

Centre Collaborateur de l'OMS

En tant que Centre Collaborateur OMS (CCOMS), le laboratoire participe à des actions collaboratives avec des organisations non gouvernementales (ONG) travaillant dans les zones d’endémie de certains virus. Il travaille notamment avec EPICENTRE (Groupe européen d’expertise en épidémiologie pratique) et MSF (Médecins Sans Frontières).

Assurance Qualité

Le CNR est engagé dans une démarche qualité, s’inscrivant dans le cadre de la politique qualité de l’Institut Pasteur.