Recherche / Plates-formes technologiques / Genopole / Plates-formes / Projets réalisés ou en cours

Projets en cours

  • Identification of infectious agents in the olfactory mucus of anosmic and dysguesic patients MUCOLFA
                  PTR N° 315
  • Identification of new infectious agents by high throughput sequencing
                  PTR  N° 301
  • Detection of emerging viral agents-DEVA
                  PTR N ° 246
  • Adaptation génétique de Plasmodium falciparum, l’agent de la malaria, à un nouvel environnement humain.
                 Génétique et Evolution des Maladies Infectieuses, UMR 2724, IRD Montpellier
  • Development of sequence-based typing method for Corynebacterium diphtheriae, Institut Pasteur, Paris
                 Unité Prévention et Thérapies Moléculaires des Maladies Humaines/CNR des
                 Corynebactéries Toxinogènes
  • Epidémies de poliomyélite dues à des poliovirus dérivés du vaccin polio oral. Echanges génétiques entre poliovirus et entérovirus humains du groupe C
                 CCOMS de Recherche sur les Entérovirus et Vaccins Viraux, Institut Pasteur, Paris
  • Etude phylogénétique de Clostridium difficile par séquençage multilocus (MLST): identification des spécificités génétiques du clone épidémique et hypervirulent O27

       Unité de Génétique Moléculaire Bactérienne, Institut Pasteur, Paris
  • Épidémiologie moléculaire de la cryptosporidiose humaine en France: application d’une méthode MLST pour caractériser les isolats de la collection nationale

       Laboratoire Ecologie du Parasitisme (ECOPA) – EA 3609 Institut Pasteur,Lille
  • Structuration génétique et flux géniques au sein du sous-genre Leishmania.
                CNR Leishmania, Laboratoire de Parasitologie, UMR5093 Université Montpellier 1
  • Définition moléculaire des souches de Salmonella.
                Unité Biodiversité des Bactéries Pathogènes Emergentes, Institut Pasteur, Paris
  • Mise au point d’une puce à ADN permettant le typage et le sous-typage des Salmonella en une seule étape.
                CNR Salmonella, Institut Pasteur, Paris
  • Mise au point d’une technique de sous-typage fin de Shigella dysenteriae de type 1 par la recherche et l’analyse de SNPs.
                CNR Shigella, Institut Pasteur, Paris
  • Etude de la variation spatio-temporelle du génotype Dengue-1 circulant en Guyane de 1995 à 2007 et comparaison avec les souches identifiées dans la faune à des périodes contemporaines.
                CNR Arbovirus et Virus Influenza, Institut Pasteur, Cayenne, Guyane
  • Evolution génétique de souches d’Helicobacter pylori isolées de patients originaires d’Afrique et d’Océanie.
                Laboratoire de Biologie Médicale, Institut Pasteur, Dakar, Sénégal
  • Staphylococcus aureus résistants à la méticilline en Afrique.
                Laboratoire de Biologie Médicale, Institut Pasteur, Dakar, Sénégal
  • Etude phylogénétique de Clostridium difficile par séquençage multilocus (MLST): identification des spécificités génétiques du clone épidémique et hypervirulent O27
                Unité de Génétique Moléculaire Bactérienne, Institut Pasteur, Paris
  • Génotypage de Cryptococcus neoformans sérotype A par MLST
                CNR Mycologie et Antifongiques

Projets réalisés

  • Analyse des isolats de grippe de l’hiver 2007/2008 résistant à l’oseltamivir
                  CNR des virus influenzae (région sud), Institut de microbiologie, Bron
  • Mise en œuvre d’une technique de typage moléculaire par séquençage de deux génes hypervariables des souches de Neisseria gonorrhoeae.
                 CNR des Gonocoques, Institut Alfred Fournier, Paris
  • Etude de la variation spatio-temporelle du genotype Dengue-2 circulant en Guyane et en Martinique de 1991 à 2006.
                CNR Arbovirus et Virus Influenza, Institut Pasteur, Cayenne, Guyane et Unité de Recherche
                 de Virologie Structurale, Institut Pasteur, Paris
  • Etude de l’histoire évolutive du virus responsable de l’épidémie de Chikungunya de l’île de la Réunion par séquençage de 6 isolats de l’océan indien.
                En collaboration avec le CNR des Arbovirus, Institut Pasteur, la plate-forme a séquencé le
                génome complet de plusieurs souches virales de Chikungunya, isolées des îles de l’Océan
                Indien. Lesséquences terminées sont mises à disposition de la communauté scientifique
                (format fasta)