• Identification of infectious agents in the olfactory mucus of anosmic and dysguesic patients MUCOLFA

                  PTR N° 315

• Identification of new infectious agents by high throughput sequencing

                  PTR  N° 301

• Detection of emerging viral agents-DEVA

                  PTR N ° 246

• Adaptation génétique de Plasmodium falciparum, l’agent de la malaria, à un nouvel environnement humain.

                 Génétique et Evolution des Maladies Infectieuses, UMR 2724, IRD Montpellier

• Development of sequence-based typing method for Corynebacterium diphtheriae, Institut Pasteur, Paris
  

                 Unité Prévention et Thérapies Moléculaires des Maladies Humaines/CNR des
                 Corynebactéries Toxinogènes

• Epidémies de poliomyélite dues à des poliovirus dérivés du vaccin polio oral. Echanges génétiques entre poliovirus et entérovirus humains du groupe C

                 CCOMS de Recherche sur les Entérovirus et Vaccins Viraux, Institut Pasteur, Paris

• Etude phylogénétique de Clostridium difficile par séquençage multilocus (MLST): identification des spécificités génétiques du clone épidémique et hypervirulent O27
  
     Unité de Génétique Moléculaire Bactérienne, Institut Pasteur, Paris

• Épidémiologie moléculaire de la cryptosporidiose humaine en France: application d’une méthode MLST pour caractériser les isolats de la collection nationale
  
     Laboratoire Ecologie du Parasitisme (ECOPA) – EA 3609 Institut Pasteur,Lille

• Structuration génétique et flux géniques au sein du sous-genre Leishmania.

                CNR Leishmania, Laboratoire de Parasitologie, UMR5093 Université Montpellier 1

• Définition moléculaire des souches de Salmonella.

                Unité Biodiversité des Bactéries Pathogènes Emergentes, Institut Pasteur, Paris

• Mise au point d’une puce à ADN permettant le typage et le sous-typage des Salmonella en une seule étape.

                CNR Salmonella, Institut Pasteur, Paris

• Mise au point d’une technique de sous-typage fin de Shigella dysenteriae de type 1 par la recherche et l’analyse de SNPs.

                CNR Shigella, Institut Pasteur, Paris

• Etude de la variation spatio-temporelle du génotype Dengue-1 circulant en Guyane de 1995 à 2007 et comparaison avec les souches identifiées dans la faune à des périodes contemporaines.

                CNR Arbovirus et Virus Influenza, Institut Pasteur, Cayenne, Guyane

• Evolution génétique de souches d’Helicobacter pylori isolées de patients originaires d’Afrique et d’Océanie.

                Laboratoire de Biologie Médicale, Institut Pasteur, Dakar, Sénégal

• Staphylococcus aureus résistants à la méticilline en Afrique.

                Laboratoire de Biologie Médicale, Institut Pasteur, Dakar, Sénégal

• Etude phylogénétique de Clostridium difficile par séquençage multilocus (MLST): identification des spécificités génétiques du clone épidémique et hypervirulent O27

                Unité de Génétique Moléculaire Bactérienne, Institut Pasteur, Paris

• Génotypage de Cryptococcus neoformans sérotype A par MLST

                CNR Mycologie et Antifongiques

                CNR Arbovirus et Virus Influenza, Institut Pasteur, Cayenne, Guyane et Unité de Recherche
                 de Virologie Structurale, Institut Pasteur, Paris