Locaux et Equipements

Localisation

La plate-forme est installée au 1er sous-sol du bâtiment BioTop (bâtiment 12 du campus de l’Institut Pasteur). La plate-forme dispose d’environ 135 m2 de laboratoires et bureaux.
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Equipements

L’équipement de la plate-forme inclut :

-Un sequenceur nouvelle génération Hiseq 2000 ( Illumina) et une station de génération de clusters Cbot
Ces appareils sont utilisés conjointement avec la Plate-forme Génomique (PF1) où ils sont localisés, et la Plate-Forme Transcriptome et Epigénome (PF2).


- Un séquenceur 96 capillaires de type ABI PRISM 3730XL DNA analyzer (Applied Biosystems), disponible à la plate-forme depuis avril 2007, permettant le passage de 8 à 12 plaques de 96 réactions par jour et présentant donc une capacité d’environ 200 000 séquences par année



  - Une station Affymetrix (Affymetrix) comprenant un four à hybridation « GeneChip Hybridization Oven 640 », une station de lavage « GeneChip Fluidics Station » pouvant laver 4 puces à la fois, un scanner « GCS 3000 » avec chargement automatique (lecture des puces 300 K, avec changement de version en mai 2007 permettant une lecture des puces 500K) et les logiciels d’analyses pour la quantification et l’analyse des signaux des puces de reséquençage



- Un système Bio-Plex de Luminex (Luminex xMap Technologies). Ce cytomètre à flux continu utilise la technologie xMAP de Luminex (Multi-Analyte Profiling) avec des microsphères de fluorescences différentes. Cette technologie de puces en suspension permet de quantifier simultanément jusqu’à 100 paramètres dans un même puits.





- neuf thermocycleurs (quatre Mastercycler (Eppendorf), un 9700, deux 9800 fast et deux veriti  (Applied Biosystems))

                          



- Un scanner de puces à ADN sur lames de verre (Genepix Axon instruments 4000B)

                                                     




- Un Nanodrop ND 8000 (Nanodrop Technologies), spectrophotomètre pour le dosage des ARN et ADN

                                                      

- Un poste de sécurité microbiologique de niveau 2 (PSM)
En plus de son équipement propre, la plate-forme PF8 bénéfice des infrastructures disponibles sur d’autres plate-formes de la Génopole Pasteur. La plate-forme interagit ainsi de façon préférentielle avec les plateformes, notamment à orientation génomique ou bioinformatique, comme les plate-formes Génomique (PF1), Puces à ADN (PF2), Intégration et Analyse Génomiques (PF4) et Synthèse d’Oligonucléotides à haut débit (PF7).