Génotypage des Pathogènes et Santé Publique
La plate-forme Génotypage des Pathogènes et Santé Publique (PF8) fournit un accès aux technologies de génotypage et de génomique pour la caractérisation moléculaire des microorganismes pathogènes d’importance en Santé Publique.
La plate-forme est une des plate-formes de la Génopole de l’Institut Pasteur et fait partie du Département Infection et Epidémiologie de l’Institut Pasteur. Elle est soutenue financièrement par l’Institut Pasteur et l’Institut de Veille Sanitaire (InVS).
Missions
La mission de la plate-forme Génotypage des Pathogènes et Santé Publique est de fournir un appui scientifique et technique aux laboratoires français de surveillance ou d’expertise microbiologique dans les domaines des maladies infectieuses, et notamment dans l’aide à l’identification, à la caractérisation moléculaire et au typage moléculaire des agents pathogènes.
Axes d’activités de la plate-forme
Les activités de la plate-forme sont organisées autour de trois axes :
1. Un service de séquençage et de génotypage réactif, dédié à la surveillance des agents pathogènes et adapté à l’urgence microbiologique.
2. Des projets de recherche collaboratifs dans le domaine de la découverte, de la génomique et de l’épidémiologie moléculaire des agents pathogènes.
3. Une recherche en biodiversité des bactéries pathogènes émergentes
Types d’activités
1. Production de données (technologie Sanger et analyse de fragments en capillaires ; séquençage Illumina ; puces à ADN de reséquençage, …)
2. Aide à l’analyse et à l’interprétation des données, de la conception à la publication des résultats, incluant des activités de bio-informatique et bio-statistique pour l’analyse des données et l’échange international des données de génotypage de type MLST , MLVA ou CRISPR .
3. Des formations sont organisées et/ou assurées régulièrement par les membres de la plate-forme