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Coûts des expériences

Les coûts sont donnés à titre indicatif et susceptibles de modifications. Il faut également prendre en compte les spécificités de votre projet qui peuvent occasionner des variations non négligeables sur le budget global de votre projet.

Mise à jour: septembre 2012


Coût des expériences Solexa

Le coût moyen de chaque expérience est raisonnable: environ 800 € par échantillon en lecture simple de 50 bases (single read) ou 1500 € en lecture double de 100 bases chacune (paired-ends), ce qui, rapporté au coût à la base de séquence, revient à diviser par 100 le coût du séquençage traditionnel de type "Sanger".

Le coût de base des consommables pour la réalisation des expériences de séquençage à très haut débit réalisées via la technologie Solexa, commercialisée par la société Illumina, intègre 4 éléments:

  1. Coût des kits de préparation des échantillons (kit "sample") pour 8-10 échantillons, 24 à 48 échantillons en kits TruSeq
  2. Coût des kits d’amplification (kit "cluster") des produits fixés sur le support de séquençage (Flow cell)
  3. Coût des kits de séquençage ( kit "séquence" avec nombre de cycles de 50 ou 100 au choix)
  4. Type de run: lecture simple dite single read (SR) ou lecture par paires appariées dite paired-ends (PE), multiplexage ou non

Pour une expérience sur 8 échantillons, il faut au minimum 1 kit "sample", un kit "cluster" et un kit "séquence".

Au coût de base, il faut prévoir un surcoût variable selon que l’unité demandeuse fait partie de l’Institut Pasteur ou non.

Dans tous les cas, des devis "à façon" seront effectués avant le démarrage de votre projet.


Prix par échantillon
Prix (euros)
SR50 SR100 PE50 PE100
Génomique ou ADN-ChIP 707 € 889 € 1137 €

1501 €

miRNA 763 € / / /
mRNA standard 744 € 926 € 1166 € 1530 €
mRNA  directionnel 782 € 964 € / /
Identification sites d'initiation 945 € 1151 € / /
                               

* Le taux de conversion utilisé par Illumina est actuellement ( mai 2012) de 1, 24 $ pour 1 €.

Il est indispensable d’utiliser les 8 canaux de la Flow Cell à chaque expérience, sachant qu’un canal est en principe dédié à un contrôle technique indispensable (qualité de la séquence, focus).

Une Flow Cell partiellement remplie occasionne des surcoûts très importants par échantillon...


Affymetrix


Contrôle qualité des acides nucléiques

Kit Prix de réalisation d'une puce
Lab-on-a-chip Nano-Pico Series II 30 €
Lab-on-a-chip DNA 1000 30 €

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