Applications


   Les puces Affymetrix sont utilisées pour l'analyse du transcriptome (expression différentielle) principalement chez l'homme et la souris

    Le séquençage Illumina est utilisé pour 3 applications principales chez une large gamme d'organismes allant des virus aux mammifères:


RNA-seq:
Analyse de l'expression différentielle (séquençage des mRNAs, miRNAs...)
Cartographie des transcrits (identification des sites d'initiation de la transcription, des isoformes, d'ARN non codants...)

ChIP-seq:
Identification des sites de fixation de facteurs de régulation, d'effets de modifications d'histones...


MedIP-seq:
Etude des profils de méthylation