Genopole / Plates-formes / PF1 - Génomique / Séquençage très haut débit - Illumina/Solexa

Fonctionnement à Plate-Forme Génomique (au 20/02/2012)

Caractéritiques des données actuellement produites

Actuellement, la Plate-Forme Génomique produit des runs Single-Read et Paired-End de 50 bp et 100 bases en routine. Les fichiers séquences (format fastq) sont issus d'un Pipeline Illumina Casava 1.7 sur une machine HiSeq2000 (estimation  de ± 100 millions de séquences par piste). Il est possible de multiplexer les échantillons avec un maximum 24 échantillons par piste.