Recherche / Plates-formes technologiques / Genopole / Plates-formes / PF1 - Génomique / Projets Séquençage réalisés
Projets réalisés à PF1
Projets de Séquençage Nouvelle Génération (NGS)
- Analyse génomique de souches d'Acinetobacter baumannii
Bruno Périchon - Patrice Courvalin - Unité des Agents Antibactériens
Rosenfeld
Projets de Séquençage "technologie Sanger"réalisés depuis 2000
- Complete genomic sequence of Candida glabrata
Bernard Dujon - Unite de Génétique Moléculaire des Levures
Koszul03
Dujon04
Talla05
GDR 2354 - Génolevures2
- Comparative Genomic - Tuberculosis complex
Karin Eiglmeier et Thierry Garnier - Unité de Génétique Moléculaire Bactérienne
- Genome sequencing of Mycobacterium ulcerans
Timothy Stinear - Unité de Génétique Moléculaire Bactérienne
Stinear07
- EST sequencing of Aspergillus nidulans
Christophe d’Enfert - Unite Biologie et Pathogénicité Fongiques
Galagan05
- PCR products sequencing - ORF of Helicobacter pylori
Agnès. Labigne - Unité de Pathogénie Bactérienne des Muqueuses
- Molecular evolution of snake venom enzymes
Valérie Choumet - Unite des Venins
Guillemin03
- EST sequencing of Entamoeba histolytica
Nancy Guillen - Unité postulante de Biologie Cellulaire du Parasitisme
Weber06
- EST sequencing of Plasmodium yoelli
George Snounou - Unité de Parasitologie Biomédicale
Gruner05
- EST sequencing of Theileria annulata
Gordon Langsley - Laboratoire de Signalisation Immunoparasitaire
Pain05
- Multilocus Sequence Typing of Candida albicans strains
Christophe d’Enfert - Unité Biologie et Pathogénicité Fongiques
Bougnoux03
Bougnoux06
Bougnoux08
Diogo08
- Genome sequencing of Legionella pneumophila (souche Paris)
Carmen Buchrieser - Laboratoire de Génomique des Microorganismes Pathogènes
Cazalet04
- Séquençagedu génome de la souche de Streptococcus gallolyticus NEM2135
Patrick Trieu-Cuot Unité de Biologie des bactéries pathogènes à Gram-positif et Philippe Glaser, Laboratoire de Génomique des Microorganismes Pathogènes
Rusniok10
- Séquence du génome d’une souche de Mycobacterium leprae d’origine brésilienne
Nadine Honoré, Unité de Génétique moléculaire bactérienne
Monot09
- Complete genomic sequence of Microcystis aeruginosa
Nicole Tandeau de Marsac - Unité des Cyanobactéries
Sielaff03
Mlouka04
Kehr06
Carre-Mlouka06
Louvel06
Guljamow07
Ziemert08
Zilliges08
Cadel-Six08
Frangeul08
Ishida09
- Allelic diversity of Plasmodium falciparum
Odile Puijalon - Unité d’Immunologie Moléculaire des Parasites
Kim04
Jambou05
Khim05
Ariey06
Noranate07
Ekala07
Legrand07
Niang08
Lim09
Steenkeste09
Noranate09
Bob10
Jambou10
Legrand
- Genome sequencing of Vibrio lentus (souche Mel 32)
Didier Mazel - Unité postulante Plasticité du Génome bactérien
Le Roux09
- Séquençage du génome de Legionella longbeachae, souche NSW150
Carmen Buchrieser - Laboratoire de Génomique des Microorganismes Pathogènes
Cazalet10
- Détermination de la séquence génomique d’une souche d’Helicobacter pylori associée à un lymphome du MALT (Mucosa Associated Lymphoïd Tissue)
Agnés Labigne - Unité de Pathogénie bactérienne des muqueuses
Thiberge10
- Séquençage du génome du spirochète aquicole Leptospira biflexa
Mathieu Picardeau, Laboratoire des Spirochètes
Picardeau08
- Etude de l’organisation des gènes codant pour les parties variables et constantes des chaines lourdes des immunoglobulines de l’alpaga (lama pacos)
Pierre Lafaye - Unité de Génétique et Biochimie du Développement
Achour08
- Analyse génétique de l’hépatoblastome
Marie-Annick Buendia - Unité de Rcherche Oncogenèse et Virologie moléculaire
- Diversité de gènes de l’immunité et infection chez l’homme : les récepteurs de la famille Toll-like
Lluis Quintana-Murci - Unité postulante Génétique évolution humaine
Barreiro09
- Diversité de la séquence des microRNAs humains
Lluis Quintana-Murci - Unité postulante Génétique évolution humaine
Quach09 - Diversité de la séquence des récepteurs IFN humain
Lluis Quintana-Murci - Unité postulante Génétique évolution humaine
Manry11
Manry11b
- Microévolution des séquences du pathogène Candida glabrata et de levures phylogénétiquement proches
Cécile Fairhead - Unité de Génétique moléculaire des levures
Thierry08
Bouchier09
Green
- Séquençage de plasmides de multirésistance aux antibiotiques de Yersinia pseudotuberculosis
Elisabeth Carniel - Unité de recherche Yersinia
- Analyse de la diversité génétique de la famille des Rhabdoviridae
Hervé Bourhy - Unité psotulante de recherche et d’expertise Dynamique des lyssavirus et adaptation à l’hôte
Delmas08
Dacheux09
- Séquençage de clones d’une banque d’ADNc d’Entamoeba histolytica
Nancy Guillen-Aghion - Unité de recherche Biologie Cellulaire du Parasitisme
Solis09
- Séquençage de clones d’une banque d’ADNc du tract reproductif des moustiques mâles d’Anopheles gambiae
Karine Eiglmeier - Unité de Biochimie et de Biologie Moléculaire des Insectes
- Diversité allélique de Plasmodium vivax et de Plasmodium falciparum
Didier Ménard - Unité de Recherche sur le Paludisme, Institut Pasteur de Madagascar
Barnadas09
Barnadas08
Menard08
Barnadas08
Mariette08
Andriantsoanirina09a
Andriantsoanirina09b
Andriantsoanirina10
Ménard10
Andriantsoanirina10b
Andriantsoanirina10c
Andriantsoanirina11
- Diversité allélique de Plasmodium
Didier Ménard - Unité d'Epidémiologie Moléculaire, Institut Pasteur de Cambodge
Khim11
kim11
Khim12
- Génomique comparative des Escherichia coli pathogènes et non pathogènes : séquence du génome de la souche pathogène intestinale E. coli 55989 incluant le chromosome et un plasmide portant les gènes de virulence.
Chantal le Bouguenec - Unité de Recherche Biologie de Bactéries pathogènes à Gram-positif
Touchon09
Martinez
- Diversité allélique de Taenia solium
Jean-François Carod - Unité Cysticercose, Institut Pasteur de Madagascar
Michelet10
Collaboration avec la Collection de l'Institut Pasteur (CIP)
Typage moléculaire des souches types bactériennes de la CIP par le séquençage du gène codant l'ARNr 16S. Cette méthode a été accréditée sous la norme ISO 17025 de 2006 à 2008.
Chantal Bizet - Collection de l'Institut Pasteur
Clermont09
Ivanova09
Chantal Bizet - Collection de l'Institut Pasteur
Clermont09
Ivanova09