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ADN : qualité et quantité à fournir

La qualité des ADN génomiques doit répondre aux critères suivants :         
  • Taille des fragments > 2kb
  • Ratios A260/280 > 1,8 et A 260/230 > 1,5
  • ADN en tampon TE1X (10 mM Tris, pH8.0/ 1mM EDTA)
  • Concentration  supérieure à 50 ng/µL
La plate-forme se charge de quantifier en PicoGreen les ADN et de les normaliser à 50 ng/µL.

De très bons résultats de génotypage de SNP ont été obtenus à partir d’ADN extraits de sang, d’écouvillons de salive, d’éponges imprégnées de salive et de lignées cellulaires.

Pour les projets de moins de 25 échantillons, les ADN peuvent être transmis à la plate-forme en microtubes.
Au delà, ils doivent être déposés en plaques 96 puits, chaque plaque étant étiquetée sur la tranche.

La quantité demandée est fonction de la lame utilisée :

Quantités requises d’ADN 

Type de lame        

Quantité minimale d’ADN par essai (ng)

Quantité d’ADN à fournir à la PF (ng)

HumanOmni1-Quad

 200

 500

Human1M-Duo

 400

 900

Human660W-Quad

 200

 500

HumanCytoSNP-12

 200

 500

iSelect

 200

 500

GoldenGate

 250

 600


Formulaire électronique à renseigner

Ce formulaire de description des échantillons est à compléter et à envoyer en version électronique à la responsable de la plate-forme, Béatrice  Regnault.

Les échantillons qui ne répondent pas aux critères de qualité demandés ne seront pas traités et vous en serez rapidement informé.