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ADN : qualité et quantité à fournir
La qualité des ADN génomiques doit répondre aux critères suivants :
De très bons résultats de génotypage de SNP ont été obtenus à partir d’ADN extraits de sang, d’écouvillons de salive, d’éponges imprégnées de salive et de lignées cellulaires.
Pour les projets de moins de 25 échantillons, les ADN peuvent être transmis à la plate-forme en microtubes.
Au delà, ils doivent être déposés en plaques 96 puits, chaque plaque étant étiquetée sur la tranche.
La quantité demandée est fonction de la lame utilisée :
-
Taille des fragments > 2kb
- Ratios A260/280 > 1,8 et A 260/230 > 1,5
- ADN en tampon TE1X (10 mM Tris, pH8.0/ 1mM EDTA)
- Concentration supérieure à 50 ng/µL
De très bons résultats de génotypage de SNP ont été obtenus à partir d’ADN extraits de sang, d’écouvillons de salive, d’éponges imprégnées de salive et de lignées cellulaires.
Pour les projets de moins de 25 échantillons, les ADN peuvent être transmis à la plate-forme en microtubes.
Au delà, ils doivent être déposés en plaques 96 puits, chaque plaque étant étiquetée sur la tranche.
La quantité demandée est fonction de la lame utilisée :
|
Type de lame |
Quantité minimale d’ADN par essai (ng) |
Quantité d’ADN à fournir à la PF (ng) |
| HumanOmni1-Quad |
200 |
500 |
|
Human1M-Duo |
400 |
900 |
|
Human660W-Quad |
200 |
500 |
|
HumanCytoSNP-12 |
200 |
500 |
|
iSelect |
200 |
500 |
|
GoldenGate |
250 |
600 |
Formulaire électronique à renseigner
Ce formulaire de description des échantillons est à compléter et à envoyer en version électronique à la responsable de la plate-forme, Béatrice Regnault.
Les échantillons qui ne répondent pas aux critères de qualité demandés ne seront pas traités et vous en serez rapidement informé.
Les échantillons qui ne répondent pas aux critères de qualité demandés ne seront pas traités et vous en serez rapidement informé.