Modalités d'accès à la Plate-Forme

Technologie BeadArray Illumina

La plate-forme est accessible à la communauté scientifique, mais les chercheurs de l'Institut Pasteur sont prioritaires.

Quantité et qualité des ADN demandées

Gel ADNg2
Le contrôle qualité des ADN reçus est systématiquement réalisé par la plate-forme par dosage au Ppicogreen et migration sur gel d’agarose. La plate-forme se charge les normaliser.
 Il vous est cependant conseillé de tester préalablement la qualité de vos échantillons avant de nous les transmettre.

La qualité des ADN génomiques doit répondre aux critères suivants :         
  • Quantité d'ADN à fournir: 15 µL à une concentration > 75 ng/µL
  • ADN en tampon TE1X (10 mM Tris, pH8.0/ 1mM EDTA)
  • Taille des fragments > 2kb
  •  Ratios A260/280 > 1,8 et A 260/230 > 1,5
     
  • Conditionnement: en plaque 96 puits
  • Identification des échantillons: fournir un fichier Excel (voir modèle)

 
Dès que le projet a été défini avec la responsable de la structure, un devis est adressé à l’utilisateur qui retournera un bon de commande avant le début des expériences.
Le demandeur devra passer sa commande auprès de Illumina (contact
Patrick Sageat) des puces choisies (prévoir un délai de 4-6 semaines) et demander la livraison sur le site de la plate-forme de l’Institut Pasteur.

Le génotypage sur puces ne pourra démarrer qu'après le bilan du contrôle qualité sur l'ensemble des ADN de la cohorte à étudier. Les échantillons qui ne répondent pas aux critères de qualité demandés ne seront pas traités et vous en serez rapidement informé.

L'excédent des ADN vous sera rendu à la fin du projet.

Contribution financière des équipes

 Le coût des lames et réactifs Illumina est à la charge des équipes demandeuses. 
 

Une participation forfaitaire est demandée pour contribuer aux coûts des contrats de maintenance du matériel de la plate-forme (cf tableau ci-dessous). 

 

Tarifs par échantillon ( en euro )

N° code produit PRESTATIONS Unité ( ADN) Tarif Public Tarif Industriel

4446

GoldenGate

l’échantillon - hors réactifs

15

17

4447

Infinium

l’échantillon - hors réactifs

30

33


 

 

 

 




Séquençage à haut-débit HiSeq2000 Illumina


Exome-Seq: Cette application est proposée en interne actuellement

La quantité d'ADN demandée est de 1µg ou 50 ng en fonction du protocole utilisé.
Ajouter la quantité nécessaire pour réaliser le contrôle qualité.



Pour plus d’information, contacter Béatrice Regnault.
Formulaires à remplir
 
- Formulaire de demande de prestation
- Formulaire de description des échantillons ADN.