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Epidémiologie des Maladies Emergentes : Equipe
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Chercheurs |
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| Arnaud Fontanet Chef d’unité 01 40 61 37 63 arnaud.fontanet@pasteur.fr Plus d’infos |
Muriel Vray Chercheur, INSERM 01 40 61 39 82 muriel.vray@pasteur.fr Plus d’infos |
Michel Garenne Démographe, IRD 01 40 61 39 58 michel.garenne@pasteur.fr Plus d’infos |
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| Tamara Giles-Vernicke Chercheur 01 40 61 82 17 tamara.giles-vernick@pasteur.fr Plus d’infos |
Romulus Breban Chercheur 01 40 61 39 65 romulus.breban@pasteur.fr Plus d’infos |
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Ingénieurs, techniciens, administratifs |
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| Yoann Madec Biostatisticien 01 40 61 38 28 yoann.madec@pasteur.fr Plus d’infos |
Loïc Chartier Biostatisticien / Data Manager 01 40 61 32 42 loic.chartier@pasteur.fr Plus d’infos |
Lénaig Le Fouler Biostatisticienne / Data Manager 01 45 68 83 23 lenaig.le-fouler@pasteur.fr Plus d’infos |
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| Laura Tondeur Biostatisticienne / Data Manager 01 40 61 39 85 laura.tondeur@pasteur.fr Plus d’infos |
Adeline Bernier Biostatisticienne 01 45 68 82 17 adeline.bernier@pasteur.fr Plus d’infos |
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Doctorants, post-doctorants |
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| Sandrine Leroy Post-Doctorante 01 40 61 38 87 sandrine.leroy@pasteur.fr Plus d’infos |
Aline Munier Post-doctorante 01 45 68 82 17 aline.munier@pasteur.fr Plus d’infos |
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| Jordi Landier Doctorant 01 40 61 37 90 jordi.landier@pasteur.fr Plus d’infos |
Juliette Paireau Doctorante 01 40 61 38 28 juliette.paireau@pasteur.fr Plus d’infos |
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Techniciens administratifs |
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| Sylvana Thepaut Secrétaire 01 40 61 37 66 sylvana.thepaut@pasteur.fr |
Géraldine Bonnefoy Assistante projet 01 40 61 31 63 geraldine.bonnefoy@pasteur.fr |
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Arnaud fontanet
Ancien interne des hôpitaux de Paris, docteur en médecine (Université Paris V) et en santé publique (Université de Harvard), Arnaud Fontanet est spécialisé en épidémiologie des maladies infectieuses et tropicales. Après avoir effectué sa thèse de doctorat sur l’efficacité de la méfloquine dans le traitement du paludisme à la frontière Thaïlande-Cambodge, il a été responsable pendant cinq ans d’un programme de recherche sur le SIDA en Ethiopie.
Depuis janvier 2002, il dirige l’Unité d’Épidémiologie des Maladies Émergentes à l’Institut Pasteur de Paris. Ses principaux thèmes de recherche sont, outre le SIDA en Afrique et en Asie, l’hépatite C en Egypte et le SRAS en Chine.
Arnaud Fontanet est également Professeur titulaire de la Chaire Santé et Développement au Conservatoire National des Arts et Métiers (Cnam) et co-Directeur de l'Ecole Pasteur-Cnam de Santé Publique.
Depuis janvier 2002, il dirige l’Unité d’Épidémiologie des Maladies Émergentes à l’Institut Pasteur de Paris. Ses principaux thèmes de recherche sont, outre le SIDA en Afrique et en Asie, l’hépatite C en Egypte et le SRAS en Chine.
Arnaud Fontanet est également Professeur titulaire de la Chaire Santé et Développement au Conservatoire National des Arts et Métiers (Cnam) et co-Directeur de l'Ecole Pasteur-Cnam de Santé Publique.
Muriel Vray
Chercheur épidémiologiste à l’INSERM, Muriel Vray est spécialisée en recherche clinique et en pharmaco-épidémiologie. Elle travaille plus particulièrement sur la méthodologie des essais pragmatiques et des études de stratégie thérapeutique. Elle a participé à l’établissement de recommandations nationales et internationales sur la méthodologie des essais d’équivalence ou de non-infériorité.
Mise à disposition auprès de l’Institut Pasteur (IP) depuis 2002, Muriel Vray collabore avec les épidémiologistes du réseau international (IP) au développement de la recherche clinique dans le domaine des maladies infectieuses.
Expert auprès de plusieurs commissions de l’AFSSAPS (AMM, Groupe VIH et Hépatites, Groupe essais cliniques), de la HAS (Groupe Intérêt et Santé Publique), de l’ANRS (AC24 et CSS6) et de l’INSERM (comité d’experts du bureau Recherches Biomédicales), Muriel Vray est responsable ou participe à divers enseignements sur la méthodologie des essais cliniques et la pharmaco-épidémiologie (DEA, DIU, CESAM..).
Muriel Vray a coordonné la méthodologie de plusieurs essais thérapeutiques multicentriques dans le domaine du VIH et des hépatites en France, en Afrique et en Asie pour l’ANRS et l’Institut Pasteur et conduit également plusieurs études d’épidémiologie descriptive dans le domaine des pathologies métaboliques chroniques.
Mise à disposition auprès de l’Institut Pasteur (IP) depuis 2002, Muriel Vray collabore avec les épidémiologistes du réseau international (IP) au développement de la recherche clinique dans le domaine des maladies infectieuses.
Expert auprès de plusieurs commissions de l’AFSSAPS (AMM, Groupe VIH et Hépatites, Groupe essais cliniques), de la HAS (Groupe Intérêt et Santé Publique), de l’ANRS (AC24 et CSS6) et de l’INSERM (comité d’experts du bureau Recherches Biomédicales), Muriel Vray est responsable ou participe à divers enseignements sur la méthodologie des essais cliniques et la pharmaco-épidémiologie (DEA, DIU, CESAM..).
Muriel Vray a coordonné la méthodologie de plusieurs essais thérapeutiques multicentriques dans le domaine du VIH et des hépatites en France, en Afrique et en Asie pour l’ANRS et l’Institut Pasteur et conduit également plusieurs études d’épidémiologie descriptive dans le domaine des pathologies métaboliques chroniques.
Michel Garenne
Sujets de recherche: Population & Santé, Démographie médicale, Mortalité, Morbidité, Causes de décès, Différences par sexe, Dynamiques démographiques des maladies infectieuses, Modèles Démographiques, Impact démographique des interventions de santé, Laboratoires de population, Etudes longitudinales, Essais cliniques.
Formation: Michel Garenne est diplômé en mathématiques (Université Paris 6), statistiques (ENSAE, Paris), et est titulaire d’un doctorat de démographie (PhD, Université de Pennsylvanie, USA, 1982).
Recherches: Il a dirigé pendant une dizaine d’années (1981-1990) un ensemble de recherches de terrain sur la population, la santé maternelle et infantile, la nutrition et les vaccins à Niakhar, au Sénégal, sous l’égide de l’ORSTOM (maintenant IRD). Il a enseigné la démographie à l’Ecole de Santé Publique de Harvard, USA pendant cinq ans (1990-1994). Depuis, il est installé à Paris, d’où il dirige divers projets de recherche sur la population et la santé en Afrique. Il est conseiller scientifique pour le laboratoire de population d’Agincourt. Il a enseigné la démographie dans diverses universités, et a animé un séminaire de recherche à l’EHESS. Depuis novembre 2002, il a rejoint l’unité d’Epidémiologie des Maladies Emergentes à l’Institut Pasteur.
Il a participé à divers comités scientifiques des organisations internationales (Nations Unies, OMS, Académie des Sciences des Etats Unis), au comité de l’INSERM «Évolutions démographiques et santé humaine», aux comités du Wellcome Trust «Population Panel» et «Health Consequences of Population Change Panel», et est membre du Conseil Scientifique de l’Institut de Médecine Tropicale de l’Université de Heidelberg.
Formation: Michel Garenne est diplômé en mathématiques (Université Paris 6), statistiques (ENSAE, Paris), et est titulaire d’un doctorat de démographie (PhD, Université de Pennsylvanie, USA, 1982).
Recherches: Il a dirigé pendant une dizaine d’années (1981-1990) un ensemble de recherches de terrain sur la population, la santé maternelle et infantile, la nutrition et les vaccins à Niakhar, au Sénégal, sous l’égide de l’ORSTOM (maintenant IRD). Il a enseigné la démographie à l’Ecole de Santé Publique de Harvard, USA pendant cinq ans (1990-1994). Depuis, il est installé à Paris, d’où il dirige divers projets de recherche sur la population et la santé en Afrique. Il est conseiller scientifique pour le laboratoire de population d’Agincourt. Il a enseigné la démographie dans diverses universités, et a animé un séminaire de recherche à l’EHESS. Depuis novembre 2002, il a rejoint l’unité d’Epidémiologie des Maladies Emergentes à l’Institut Pasteur.
Il a participé à divers comités scientifiques des organisations internationales (Nations Unies, OMS, Académie des Sciences des Etats Unis), au comité de l’INSERM «Évolutions démographiques et santé humaine», aux comités du Wellcome Trust «Population Panel» et «Health Consequences of Population Change Panel», et est membre du Conseil Scientifique de l’Institut de Médecine Tropicale de l’Université de Heidelberg.
Tamara Giles-Vernick
Tamara Giles-Vernick est Docteur en Histoire Africaine avec une spécialisation en Anthropologie (Johns Hopkins University). Elle a également suivi des études à Oxford University et à la London School of Economics. Avant de rejoindre l’Unité en 2009, elle a été professeur dans plusieurs universités américaines (University of Minnesota, 2003-2008 ; City University of New York, 2001-2003 ; University of Virginia, 1996-2001).
Ses recherches principales sont centrées sur l’anthropologie médicale des contextes sociaux, les modes de transmission, et les moyens de prévention des agents infectieux. Ses projets comprennent la prévention du paludisme en Afrique sub-saharienne, une ethnographie de l’hépatite B et sa vaccination en Afrique de l’ouest et l’Afrique centrale, et une étude ethnographique sur les injections médicales et la transmission de l’hépatite C en Egypte.
Ses autres thèmes de recherche incluent l’histoire comparative de la grippe (co-éditeur avec Susan Craddock, Influenza and Public Health, Earthscan 2010) ; la santé globale en Afrique (co-éditeur avec James L.A. Webb, Jr, Global Health in Africa, sous contrat avec Ohio Univ Press) ; la surveillance épidémiologique du point de vue des sciences sociales.
Ses recherches principales sont centrées sur l’anthropologie médicale des contextes sociaux, les modes de transmission, et les moyens de prévention des agents infectieux. Ses projets comprennent la prévention du paludisme en Afrique sub-saharienne, une ethnographie de l’hépatite B et sa vaccination en Afrique de l’ouest et l’Afrique centrale, et une étude ethnographique sur les injections médicales et la transmission de l’hépatite C en Egypte.
Ses autres thèmes de recherche incluent l’histoire comparative de la grippe (co-éditeur avec Susan Craddock, Influenza and Public Health, Earthscan 2010) ; la santé globale en Afrique (co-éditeur avec James L.A. Webb, Jr, Global Health in Africa, sous contrat avec Ohio Univ Press) ; la surveillance épidémiologique du point de vue des sciences sociales.
Romulus Breban
Physicien de formation, Romulus Breban s’est orienté vers la modélisation mathématique des maladies infectieuses. Il a travaillé pendant quatre ans dans le laboratoire de Sally Blower à l’Université de Californie Los Angeles, où il a développé plusieurs modèles, notamment sur l’infection par le vih, la syphilis et la grippe. Il a ensuite cherché à modéliser le réservoir naturel de la grippe humaine, la grippe aviaire chez l’oiseau aquatique sauvage, avec Pejman Rohani (School of Ecology, University of Georgia).
Yoann Madec
Yoann Madec a rejoint l’unité en janvier 2005 en tant que biostatisticien. Il est titulaire d’un DEA de Santé Publique, option statistiques (PARIS 11) et d’un doctorat en Statistiques (Paris 5).
Au sein de l’unité, Yoann Madec travaille essentiellement sur l’analyse de cohortes de patients infectés par le VIH dans les pays en voie de développement. Il apporte aussi une aide méthodologique quant à l’utilisation des modèles statistiques sur différents projets au sein de l’équipe ainsi qu’en collaboration avec des équipes extérieures (Médecins Sans Frontières, Agence de médecine préventive …)
Yoann Madec participe également à l’enseignement des méthodes statistiques au sein du cours d’épidémiologie et biostatistiques de l’école pasteurienne d’infectiologie, et au CESAM (Centre d’Enseignement de la Statistique Appliquée à la Médecine).
Au sein de l’unité, Yoann Madec travaille essentiellement sur l’analyse de cohortes de patients infectés par le VIH dans les pays en voie de développement. Il apporte aussi une aide méthodologique quant à l’utilisation des modèles statistiques sur différents projets au sein de l’équipe ainsi qu’en collaboration avec des équipes extérieures (Médecins Sans Frontières, Agence de médecine préventive …)
Yoann Madec participe également à l’enseignement des méthodes statistiques au sein du cours d’épidémiologie et biostatistiques de l’école pasteurienne d’infectiologie, et au CESAM (Centre d’Enseignement de la Statistique Appliquée à la Médecine).
Lenaig Le Fouler
Lénaig Le Fouler est titulaire d’un Master Pro en Santé Publique (Université Paris XI).
Elle a rejoint l’Unité en Septembre 2007 comme Biostatisticienne-Data Manager. Elle est amenée à travailler dans le domaine de la recherche clinique en partenariat avec le réseau de l’Institut Pasteur. Ses fonctions principales sont d’assurer le data management pour les études de l’unité, de former les partenaires aux bases de données et en statistiques, d’assurer toutes les actions liées à l’informatique et de participer à l’analyse statistique des études réalisées dans l’unité.
Elle a rejoint l’Unité en Septembre 2007 comme Biostatisticienne-Data Manager. Elle est amenée à travailler dans le domaine de la recherche clinique en partenariat avec le réseau de l’Institut Pasteur. Ses fonctions principales sont d’assurer le data management pour les études de l’unité, de former les partenaires aux bases de données et en statistiques, d’assurer toutes les actions liées à l’informatique et de participer à l’analyse statistique des études réalisées dans l’unité.
Loïc Chartier
Loïc Chartier est titulaire d’un Master Pro en Santé Publique (Université Paris XI).
Après une première expérience en CRO, Loïc a rejoint l’unité en juillet 2002 en tant que Biostatisticien-Data Manager.
Il est amené à travailler dans le domaine de la recherche clinique en partenariat avec le réseau de l’Institut Pasteur. Ses fonctions principales sont d’assurer le data management pour les études de l’unité, de former les partenaires aux bases de données et en statistiques, d’assurer toutes les actions liées à l’informatique, et de réaliser les analyses statistiques.
Il participe également à l’enseignement des aspects Data Management et des méthodes statistiques au sein des cours « Analyse de données avec Stata » et « Création et gestion des bases de données / Microsoft Access et Epidata » de l’Ecole Pasteurienne d’Infectiologie.
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Après une première expérience en CRO, Loïc a rejoint l’unité en juillet 2002 en tant que Biostatisticien-Data Manager.
Il est amené à travailler dans le domaine de la recherche clinique en partenariat avec le réseau de l’Institut Pasteur. Ses fonctions principales sont d’assurer le data management pour les études de l’unité, de former les partenaires aux bases de données et en statistiques, d’assurer toutes les actions liées à l’informatique, et de réaliser les analyses statistiques.
Il participe également à l’enseignement des aspects Data Management et des méthodes statistiques au sein des cours « Analyse de données avec Stata » et « Création et gestion des bases de données / Microsoft Access et Epidata » de l’Ecole Pasteurienne d’Infectiologie.
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Laura Tondeur
Laura Tondeur est titulaire d’un Master Pro en Santé Publique, mention Biostatistiques (ISPED, Bordeaux).
Après une première expérience dans une équipe INSERM basée à l’Institut Gustave Roussy, elle a rejoint l’unité en décembre 2011 comme Biostatisticien-Data Manager. Elle est amenée à travailler dans le domaine de l'épidémiologie et de la recherche clinique en partenariat avec le Réseau International des Instituts Pasteur. Ses fonctions principales sont d’assurer le data management pour les études de l’unité, de former les partenaires aux bases de données et en statistiques, d’assurer toutes les actions liées à l’informatique et de participer à l’analyse statistique des études réalisées dans l’unité.
Adeline Bernier
Après une formation initiale en biologie (Ecole Normale Supérieure et Master 2 Physiologie, Physiopathologie à l’université Pierre et Marie Curie), Adeline Bernier a obtenu un mastère spécialisé en Santé publique, Risques Infectieux, à l’Ecole Pasteur/Cnam.
Elle a rejoint l’unité en mars 2012 pour travailler à la rédaction des stratégies nationales de lutte contre les hépatites virales pour la période 2013-2017 en Egypte, dans le cadre d’un groupe de travail OMS coordonné par Arnaud Fontanet. Elle participera également à l’analyse des modes de transmission de l’hépatite C sur la base de données de la cohorte hépatite aigüe C.
Aline Munier
Docteur en Pharmacie (Paris XI), titulaire d’un DEA de santé publique dans les pays en développement et d’un doctorat d’épidémiologie (Paris VI) portant sur le paludisme, Aline Munier réalise un post-doctorat au sein de l’unité.
Elle travaille sur des projets liés à l’hépatite C en Egypte, en particulier les accidents d’exposition au sang chez les personnels de santé en milieu hospitalier au Caire, et l’étude des facteurs associés à la transmission et à l’élimination du virus de l’hépatite C.
Elle travaille sur des projets liés à l’hépatite C en Egypte, en particulier les accidents d’exposition au sang chez les personnels de santé en milieu hospitalier au Caire, et l’étude des facteurs associés à la transmission et à l’élimination du virus de l’hépatite C.
Jordi Landier
Jordi Landier prépare un doctorat en Santé Publique-Epidémiologie à l’Université Pierre et Marie Curie (Paris 6) depuis Septembre 2010, après une formation initiale en Biologie et un mastère en Santé Publique, spécialisation Risque infectieux, obtenu à l’Ecole Pasteur-CNAM.
Son travail de thèse porte sur l’épidémiologie de l’ulcère de Buruli (infection à Mycobacterium ulcerans). Il s’intéresse à la transmission de M. ulcerans, dont le mécanisme demeure inexpliqué. Son terrain d’études est situé au Cameroun, où il travaille avec le Service de Mycobactériologie du Centre Pasteur du Cameroun.
Il s’intéresse également aux aspects épidémiologiques du traitement et de la prise en charge des patients atteints d’ulcère de Buruli.
Son travail de thèse porte sur l’épidémiologie de l’ulcère de Buruli (infection à Mycobacterium ulcerans). Il s’intéresse à la transmission de M. ulcerans, dont le mécanisme demeure inexpliqué. Son terrain d’études est situé au Cameroun, où il travaille avec le Service de Mycobactériologie du Centre Pasteur du Cameroun.
Il s’intéresse également aux aspects épidémiologiques du traitement et de la prise en charge des patients atteints d’ulcère de Buruli.
Juliette Paireau
Juliette Paireau est doctorante au sein de l’Unité depuis octobre 2010.
Ingénieur diplômée de Chimie ParisTech et titulaire du Mastère Spécialisé en Santé Publique de l’Ecole Pasteur/CNAM, Juliette Paireau s’est orientée vers l’épidémiologie spatiale (détection de clusters spatiaux, études de corrélation géographique…). Au cours de stages dans l’Unité et au Centre de Recherche Médicale et Sanitaire (CERMES) de Niamey, elle a travaillé sur l’apport de l’analyse spatiale à la compréhension de la dynamique des épidémies.
Son doctorat, préparé en collaboration avec le CERMES, porte sur l’épidémiologie spatiale de la méningite à méningocoque au Niger et l’influence des facteurs environnementaux et climatiques sur la dynamique spatio-temporelle des épidémies.
Ingénieur diplômée de Chimie ParisTech et titulaire du Mastère Spécialisé en Santé Publique de l’Ecole Pasteur/CNAM, Juliette Paireau s’est orientée vers l’épidémiologie spatiale (détection de clusters spatiaux, études de corrélation géographique…). Au cours de stages dans l’Unité et au Centre de Recherche Médicale et Sanitaire (CERMES) de Niamey, elle a travaillé sur l’apport de l’analyse spatiale à la compréhension de la dynamique des épidémies.
Son doctorat, préparé en collaboration avec le CERMES, porte sur l’épidémiologie spatiale de la méningite à méningocoque au Niger et l’influence des facteurs environnementaux et climatiques sur la dynamique spatio-temporelle des épidémies.
Sandrine Leroy
Médecin-pédiatre de formation, Sandrine Leroy est aussi docteur en Epidémiologie (Université Paris 6). Elle a travaillé pendant plus de 2 ans au Centre for Statistics in Medicine (University of Oxford, UK) sur les méta-analyses, la construction d’algorithme de prédiction diagnostique et pronostique, et mené une réflexion méthodologique sur les outils utilisés dans la recherche diagnostique. Ses thématiques d’application ont été les maladies infectieuses et l’immunoloie, pédiatrique ou non.
Au sein de l’unité, qu’elle a rejointe en octobre 2010, elle travaille sur la construction et validation d’algorithmes prédictifs de la guérison de l’hépatite C en phase aiguë (cohorte égyptienne) ou en réponse à un traitement, en étroite collaboration avec le Centre d’Immunologie humaine de M Albert. L’originalité de ce projet est l’intégration de techniques statistiques de type data mining aux concepts épidémiologiques usuels pour analyser les données issues de la révolution -omics, inhabituelles et peu adaptées aux techniques classiques.
Au sein de l’unité, qu’elle a rejointe en octobre 2010, elle travaille sur la construction et validation d’algorithmes prédictifs de la guérison de l’hépatite C en phase aiguë (cohorte égyptienne) ou en réponse à un traitement, en étroite collaboration avec le Centre d’Immunologie humaine de M Albert. L’originalité de ce projet est l’intégration de techniques statistiques de type data mining aux concepts épidémiologiques usuels pour analyser les données issues de la révolution -omics, inhabituelles et peu adaptées aux techniques classiques.


