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Unité d'Epidémiologie des
Maladies Emergentes
Institut Pasteur
25-28 rue du Dr Roux
75724 Paris Cedex 15
Tél : +33 (0)1 40 61 37 66
Fax: +33 (0)1 45 68 88 76
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Epidémiologie des Maladies Emergentes : Enseignement
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Introduction à l’épidémiologie, aux biostatistiques et validation des tests diagnostiques
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Objectifs du cours
Ce cours est délivré dans le cadre de l’Ecole Pasteurienne d’Infectiologie (EPI). Son objectif est de familiariser les étudiants aux notions de base de l’épidémiologie et des biostatistiques et de leur donner les outils nécessaires pour les études de validation des tests diagnostiques. Pré-requis
Formation dispensée en langue française. Une compréhension parfaite de la langue française sera exigée. Pré-requis : Les étudiants devront avoir une formation biomédicale de niveau Baccalauréat +3.
Planning
Le cours, d’une durée d’une semaine, comprendra une alternance d’exposés théoriques et de travaux dirigés. Deux journées seront consacrées à l’apprentissage des estimations (moyenne, médiane), des mesures de dispersion (écart-type, variance), et à la théorie des tests (comparaison de moyennes et pourcentages). Une journée sera dédiée aux types d’étude (études cas-témoins, cohortes, essais cliniques), aux mesures d’association (risque relatif, odds ratios), et aux biais (sélection, classement, confusion) rencontrés en épidémiologie. Enfin, deux journées seront consacrées aux études de validation des tests diagnostiques : méthodologie de l’évaluation (protocole STARD), et mesures utilisées (sensibilité, spécificité, valeurs prédictives, courbes ROC).
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INTRODUCTION A L’EPIDEMIOLOGIE ET AUX BIOSTATISTIQUES ET VALIDATION DES TESTS DIAGNOSTIQUES
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| Jour 1 |
| 9h00-9h30 |
Accueil des étudiants |
M. Vray |
| 9h30-11h00 |
Notion de la variabilité en statistiques. Les différents types de variables aléatoires. Représentation des résultats (tableaux et graphiques)
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M. Vray |
| 11h00-11h45 |
Exercices |
M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler
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| 11h45-12h45 |
Indices de position (moyenne, médiane, mode), indices de dispersion (variance, écart-type)
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M. Vray |
| 14h00-15h30 |
Loi binomiale et loi normale. Fluctuations d’échantillonnage d’une moyenne et d’une proportion
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M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler |
| 15h30-17h00 |
Exercices |
M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler |
| Jour 2 |
| 9h00-10h30 |
Théorie des tests, notions de risque Intervalle de confiance, distribution de Student |
M. Vray |
| 10h30-12h00 |
Les principaux tests statistiques, comaparaison de 2 moyennes, comparaison de 2 proportions
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M. Vray |
| 12h00-12h30 |
Exercices
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M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler |
| 14h00-14h30 |
Exercices
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M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler |
| 14h30-16h00 |
Cas des séries appariées (Test de Mac Nemar), intervalle de confiance
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M. Vray
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| 16h00-17h00 |
Exercices
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M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler |
| Jour 3 |
| 9h00-10h30 |
Types d'études épidémiologiques
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E. Delarocque-Astagneau |
| 10h30-12h00 |
Mesures fondamentales en épidémiologie
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E. Delarocque-Astagneau |
| 14h00-15h30 |
Mesures d'association
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E. Delarocque-Astagneau |
| 15h30-17h00 |
Interprétation d'une association : rôles de la chance, des biais et facteurs de confusion
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E. Delarocque-Astagneau |
| Jour 4 |
| 9h00-10h30 |
Introduction aux tests diagnostiques
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M. Vray
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| 10h30-12h00 |
Reproductibilité des tests diagnostiques. Coefficient de Kappa, Coefficient de corrélation intraclasse, diagramme de Bland et Altman
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M. Vray
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| 14h00-17h00 |
Exercices
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M. Vray, L. Chartier, L. Le Fouler
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| Jour 5 |
| 9h00-10h45 |
Planification d'une étude de diagnostique. Protocole et biais
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M. Vray
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| 10h45-12h30 |
Indices de performance, Sensibilité et spécificité, Courbes ROC
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M. Vray
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| 14h00-17h00 |
Exercices
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M. Vray, L. Chartier, L. Le Fouler |
Contacts
Co-Directeurs
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Arnaud FONTANET
Institut Pasteur
Unité de Recherche et d’Expertise Epidémiologie des Maladies Emergentes
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Tél : 01 40 61 37 63
Fax : 01 45 68 88 76
E.mail : arnaud.fontanet@pasteur.fr
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Muriel VRAY
Institut Pasteur
Unité de Recherche et d’Expertise Epidémiologie des Maladies Emergentes
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Tél : 01 40 61 39 82
Fax : 01 45 68 88 76
E.mail : muriel.vray@pasteur.fr
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Inscription
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