Epidémiologie des Maladies Emergentes : Enseignement

Introduction à l’épidémiologie, aux biostatistiques et validation des tests diagnostiques

Objectifs du cours

Ce cours est délivré dans le cadre de l’Ecole Pasteurienne d’Infectiologie (EPI). Son objectif est de familiariser les étudiants aux notions de base de l’épidémiologie et des biostatistiques et de leur donner les outils nécessaires pour les études de validation des tests diagnostiques.

Pré-requis

Formation dispensée en langue française. Une compréhension parfaite de la langue française sera exigée. Pré-requis : Les étudiants devront avoir une formation biomédicale de niveau Baccalauréat +3.

Planning

Le cours, d’une durée d’une semaine, comprendra une alternance d’exposés théoriques et de travaux dirigés. Deux journées seront consacrées à l’apprentissage des estimations (moyenne, médiane), des mesures de dispersion (écart-type, variance), et à la théorie des tests (comparaison de moyennes et pourcentages). Une journée sera dédiée aux types d’étude (études cas-témoins, cohortes, essais cliniques), aux mesures d’association (risque relatif, odds ratios), et aux biais (sélection, classement, confusion) rencontrés en épidémiologie. Enfin, deux journées seront consacrées aux études de validation des tests diagnostiques : méthodologie de l’évaluation (protocole STARD), et mesures utilisées (sensibilité, spécificité, valeurs prédictives, courbes ROC).


INTRODUCTION A L’EPIDEMIOLOGIE ET AUX BIOSTATISTIQUES ET VALIDATION DES TESTS DIAGNOSTIQUES

Jour 1
9h00-9h30 Accueil des étudiants M. Vray
9h30-11h00 Notion de la variabilité en statistiques. Les différents types de variables aléatoires. Représentation des résultats (tableaux et graphiques)
M. Vray
11h00-11h45 Exercices M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler
11h45-12h45 Indices de position (moyenne, médiane, mode), indices de dispersion (variance, écart-type)
M. Vray
14h00-15h30 Loi binomiale et loi normale. Fluctuations d’échantillonnage d’une moyenne et d’une proportion
M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler
15h30-17h00 Exercices M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler
Jour 2
9h00-10h30 Théorie des tests, notions de risque Intervalle de confiance, distribution de Student M. Vray
10h30-12h00 Les principaux tests statistiques, comaparaison de 2 moyennes, comparaison de 2 proportions
M. Vray
12h00-12h30 Exercices
M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler
14h00-14h30 Exercices
M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler
14h30-16h00 Cas des séries appariées (Test de Mac Nemar), intervalle de confiance
M. Vray
16h00-17h00 Exercices
M. Vray, L. Chartier et L. Le Fouler
Jour 3
9h00-10h30 Types d'études épidémiologiques
E. Delarocque-Astagneau
10h30-12h00 Mesures fondamentales en épidémiologie
E. Delarocque-Astagneau
14h00-15h30 Mesures d'association
E. Delarocque-Astagneau
15h30-17h00 Interprétation d'une association : rôles de la chance, des biais et facteurs de confusion
E. Delarocque-Astagneau
Jour 4
9h00-10h30 Introduction aux tests diagnostiques
M. Vray
10h30-12h00 Reproductibilité des tests diagnostiques. Coefficient de Kappa, Coefficient de corrélation intraclasse, diagramme de Bland et Altman
M. Vray
14h00-17h00 Exercices
M. Vray, L. Chartier, L. Le Fouler
Jour 5
9h00-10h45 Planification d'une étude de diagnostique. Protocole et biais
M. Vray
10h45-12h30 Indices de performance, Sensibilité et spécificité, Courbes ROC
M. Vray
14h00-17h00 Exercices
M. Vray, L. Chartier, L. Le Fouler

 


Contacts

Co-Directeurs

Arnaud FONTANET
Institut Pasteur
Unité de Recherche et d’Expertise Epidémiologie des Maladies Emergentes

Tél : 01 40 61 37 63
Fax : 01 45 68 88 76
E.mail : arnaud.fontanet@pasteur.fr

Muriel VRAY
Institut Pasteur
Unité de Recherche et d’Expertise Epidémiologie des Maladies Emergentes

Tél : 01 40 61 39 82
Fax : 01 45 68 88 76
E.mail : muriel.vray@pasteur.fr


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