Unité de Dynamique Structurale des Macromolécules

Unité de Dynamique Structurale des Macromolécules -                   Marc DELARUE

Activités de l'Unité

Le but du laboratoire est de comprendre au niveau moléculaire la structure et la fonction de nanomachines biologiques impliquées dans les mécanismes fondamentaux de la vie. Nous utilisons au quotidien une combinaison de techniques expérimentales (cristallographie aux Rayons X) et computationnelles, classiques (dynamique moléculaire) ou développées par nous (méthodes gros grains, électrostatique).

-La première classe de molécules etudiées concerne le métabolisme de l’ADN et le cancer avec les topoisomérases et les ADN polymérases, en particulier celles qui interviennent dans la réparation des coupures double brins de l’ADN.

-La seconde classe de molécules, etudiées en collaboration avec le groupe de P.J. Corringer, sont des protéines membranaires de la famille des canaux ioniques pentamériques comme le récepteur nicotinique, en particulier un analogue bactérien declenché par le pH.

Accueil: groupe de Marc Delarue

                      
  Récepteur cys-loop pentamérique sensible au pH, dans son environnement membranaire Modèle gros-grains de la citrate synthase par le Réseau élastique 

Les 3 publications les plus significatives :
  1. Nury, H., Van Renterghem, C., Weng, Y., Tran, A., Baaden, M., Dufresne, V., Changeux, J.-P., Sonner, J.-M., Delarue, M. and Corringer, P.-J. (2011) X-ray structures of general anaesthetics bound to a pentameric ligand-gated ion channel. Nature, 469, 428-431.
  2. Romain, F., Barbosa, I., Gouge, J., Rougeon, F. and Delarue, M. (2009) Conferring a template-dependent polymerase activity to terminal deoxynucleotidyltransferase by mutations in the Loop1 region. Nucleic Acids Res., 37, 4642-4656.
  3. Koehl, P., Orland, H. and Delarue, M. (2009) Beyond the Poisson-Boltzmann model: modeling biomolecule-water and water-water interactions. Phys. Rev. Lett., 102, (8):087801. Epub 2009 Feb 24.