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L’Institut Pasteur organise la 12e édition du colloque JOBIM (Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques), le rendez-vous annuel de la communauté bio-informatique francophone, placé sous l’égide de la Société Française de Bio-Informatique (SFBI).

Les journées auront lieu du mardi 28 juin 2011 matin au vendredi 1^er juillet 2011 midi.

Les années précédentes, la conférence JOBIM s'est déroulée à Montpellier, à Nantes, à Lille, à Marseille, à Bordeaux...

Thématiques

Les thèmes abordés par JOBIM couvrent le spectre de la bio-informatique au sens large. Cela comprend à la fois les aspects méthodologiques en amont (modélisation mathématique, informatique, statistique, physique), les outils logiciels et des contributions plus appliquées, allant jusqu'à l'établissement de nouveaux résultats en biologie.

Sans être exhaustif, on peut citer les domaines suivants :

• génomique, génomique comparative et métagénomique
• évolution et phylogénie
• biodiversité, génétique et génomique des populations
• analyse des séquences et recherche de motifs
• cartographie et annotation des génomes
• biologie des systèmes et réseaux biologiques
• structures des macromolécules
• protéomique et interactions
• expression des gènes, génomique fonctionnelle
• analyse de données de grand séquençage
• ARN non codants
• épigénétique et épigénomique
• ontologies, bases de données, intégration de données
• algorithmique et statistiques pour la bio-informatique
• etc.

Nouveautés JOBIM 2011

Cette année, des sessions thématiques parallèles ont été mises en place, avec pour objectif de permettre à davantage d'orateurs de s'exprimer et de favoriser les échanges informels dans la communauté.

Il n'y aura pas de journées satellites.

L'existence d'une session parallèle sur un thème précis etait conditionnée par la soumission d'un nombre suffisant d'articles sur ce thème. Pour qu'un domaine soit bien représenté, les différentes communautés scientifiques de JOBIM ont donc été incitées à soumettre largement leurs travaux.

L'augmentation significative du nombre de présentations orales, et leur sélection sur résumé court ou long, avait également pour objectif d'encourager les étudiants en thèse et les post-doctorants à venir présenter leurs résultats à JOBIM. Des prix à destination des ces jeunes chercheurs seront décernés pour la meilleure présentation sur affiche et pour la meilleure présentation orale.

Dates importantes

• 8 février : ouverture des soumissions d'articles
• 2 mars 9 mars : fin des soumissions d'articles
• 14 avril : notifications aux auteurs
• 18 avril : ouverture des soumissions de posters
• 9 mai : version définitive des articles
• 12 mai : fin des soumissions de posters
• 16 mai 20 mai : majoration des inscriptions
• 17 juin : clôture des inscriptions
• 28 juin au 1er juillet : conférence