INGENIEUR BIO INFORMATICIEN H/F

Un poste d’Ingénieur Bio-informaticien est à pourvoir au sein de la Plate-forme « Bioanalyse Génomique » de l’Institut Pasteur (CDD de 18 mois). 
 

Activités :

Dans le cadre de missions définies en concertation avec les partenaires de France Génomique, vous devrez contribuer à la mise en place de ressources pour l'identification de variants génomiques (SNPs, indels, CNVs, variants structuraux, etc.) à partir de l'analyse de données de séquençage à haut débit (NGS).

En particulier, vous serez chargé(e) de :

• Évaluer les outils existants, fournir une veille technologique ;

• Identifier les carences et les goulets d'étranglement ;

• Participer à la définition et à l'implémentation de nouvelles méthodologies et stratégies d'analyse ;

• Mettre à disposition des biologistes et de la communauté France Génomique les ressources pertinentes, à travers des portails utilisateurs tels que Galaxy.

L'accent sera mis sur les applications dans le domaine du polymorphisme microbien, en liaison directe avec les projets de génomique microbienne menés à l'Institut Pasteur. 
 

Profil :

Diplôme BAC+5 minimum avec double compétence en informatique et biologie (bio-informatique ou informatique avec spécialisation).

Expérience souhaitée dans la manipulation informatique des données NGS.

 

Compétences : 

• Connaissance des principaux logiciels et méthodes de bio-informatique, en particulier ceux utilisés en génomique et pour les analyses de données NGS.

• Utilisation d’environnements UNIX (shell) et d’outils de développement collaboratifs (SVN, Redmine...).

• Maîtrise de la programmation (langages impératifs et langages de script).

• Des connaissances sur les bases de données, XML, les technologies web, et les statistiques constitueront un plus important.

• Aisance dans un environnement multidisciplinaire, goût du travail en équipe et sens du relationnel.

• Curiosité scientifique, rigueur méthodologique, esprit de synthèse et qualités rédactionnelles.

• Anglais lu, écrit
   

Déplacements:

Interactions avec les partenaires France Génomique, colloques…

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