Ingénieur informatique H/F
réf : 12173CP
MAJ : 20/08/2012
Définition du poste
Un poste d’Ingénieur Informatique « Intégration Outils » est à pourvoir au sein du Centre d’informatique pour la Biologie (CIB), dans le cadre d'un CDD de 18 mois.
Rattaché à la Direction déléguée aux systèmes d’information de l’Institut Pasteur, le (CIB) a en charge la réponse aux besoins informatiques des scientifiques du campus.
Dans le cadre de ses missions, le CIB met à disposition du campus des logiciels scientifiques, des banques de données et un portail Web d’accès aux ressources bio-informatiques disponibles pour l’institut. Le CIB fait également évoluer le SI existant en développant de nouvelles fonctionnalités et en intégrant de nouveaux outils demandés par les scientifiques.
La plateforme Galaxy, plateforme de publication et de gestion de méthodes d’analyse de données devenue référence incontournable du domaine, a fait l’objet d’un début de mise en place à l’Institut Pasteur. Le recrutement vise à renforcer les capacités du CIB pour intégrer dans cette solution, à des fins de mutualisation et de partage des meilleurs pratiques, des outils et des développements réalisés de manière isolée dans les entités scientifiques de l’Institut.
Les missions attendues dans le cadre de ce recrutement pourront également conduire à la réalisation d’intégration dans des outils complémentaires à Galaxy (Mobyle notamment) ainsi qu’au développement d’outils plus basiques associant interface web et base de données.
Tâches principales :
Rattaché(e) au responsable du CIB, vous serez chargé(e) :
- des demandes d'intégration d'outils dans la plateforme Galaxy,
- de veiller au maintien des outils intégrés dans Galaxy,
- d’accompagner les activités d’intégration dans d’autres outils en soutien aux activités du CIB,
- de réaliser des développements sur des projets d'interface web et de base de données.
Profil :
Diplômé BAC + 5/+8 (école d’Ingénieur/Doctorat) ou équivalent en Bio-informatique, vous disposez des compétences suivantes :
- Connaissance de la plateforme Galaxy.
- Connaissance développement web, architecture 3-tiers (MVC),CGI, serveur d'application.
- Bonne connaissance des techniques de web dynamique (AJAX,CSS,Web Services).
- Connaissance d'un IDE (Eclipse) de programmation.
- Programmation objet (JAVA/Perl/Python/C++).
- Connaissances dans la création, la gestion et l'administration des bases de données relationnelles (MySQL/PostGreSQL/Sybase).
- La connaissance des systèmes NoSQL serait un plus.
Compétences :
Idéalement vous disposez également d’une base solide en biologie et analyses génomiques. Vous avez une très bonne connaissance des outils bioinformatiques dédiés aux analyses génomiques, et en particulier aux NGS.
Vous savez travailler en équipe. Vous parlez anglais couramment. Vous savez être force de proposition. On vous reconnaît des qualités de méthodes et de rigueur, même lorsque vous devez gérer plusieurs sujets en parallèle.