Enseignement

Cours de Microbiologie Générale


  Directeur :

Dr Chantal Le Bouguénec
Unité de Recherche Biologie des Bactéries pathogènes à Gram-positif, Institut Pasteur


Chef de travaux :

Dr Christophe Beloin
Unité de recherche génétique des Biofilms,
Institut Pasteur

Formation à la Recherche en Microbiologie comprenant des conférences et des travaux pratiques organisés par des chercheurs dans la spécialité. Un niveau de connaissances en biochimie, biologie moléculaire et génétique du niveau de la fin de la première année de Master est recommandé.

Formation dispensée en langue française (avec des conférences en anglais).


            Le programme comporte  quatre modules :

1 - Cycle de conférences (3 au 14 septembre 2012)

Programme scientifique et encadrement : Chantal Le Bouguénec et Christophe Beloin (Institut Pasteur)
Cet enseignement comporte des conférences généralistes de microbiologie procaryote et eucaryote ayant pour but d'actualiser les connaissances sur les différents domaines de la microbiologie et des conférences plus spécialisées ayant pour objectif d'identifier les thématiques en plein essor et les nouveaux outils permettant leur développement.

2 - Des travaux de laboratoire sur le thème de la Biodiversité des communautés aquatiques microbiennes  (17 au 28 septembre 2012)

Programme scientifique et encadrement : Jean-François Humbert (UMR Bioemco, site de l'ENS) et Martine Kiredjian (Institut Pasteur)
 L'objectif de ces Travaux Pratiques est de vous initier aux démarches méthodologiques des deux types d’approche (isolement/biologie moléculaire) utilisées dans le cadre de travaux portant sur l’étude comparée de la composition et de la diversité de communautés microbiennes de différents écosystèmes continentaux.

3. Des travaux de laboratoire le thème "Caractérisation des voies de réponse aux antibiotiques en concentration sub-inhibitrice chez Vibrio cholerae" (1 au 16 octobre 2012)

Programme scientifique et encadrement : Unité Plasticité du génome bactérien dirigée par Didier Mazel (Institut Pasteur)
L'objectif de ces travaux pratiques est de construire et cribler une banque de mutants de Vibrio cholerae pour rechercher des facteurs qui lui seraient spécifiques et qui font que les antibiotiques tétracycline, chloramphénicol et aminoglycosides (kanamycine, tobramycine, streptomycine, gentamicine) induisent SOS chez V. cholerae et pas chez la bactérie modèle E. coli.

4. Des travaux de laboratoire sur le thème " Etude de l’effet des ions calcium sur la formation de biofilms bactériens"  (17 au 31 octobre 2012)

Programme scientifique et encadrement : Unité de Génétique des biofilms dirigée par Jean-Marc Ghigo (Institut Pasteur)
L’objectif de ces travaux pratiques est d’explorer les conséquences et les déterminants de la formation de biofilm en présence de calcium en utilisant la bactérie Escherichia coli K-12 comme modèle d’étude. Une analyse combinant microbiologie classique, microscopie, biochimie et génétique sera mise en œuvre pour cerner progressivement les déterminants moléculaires à l’origine de ce phénotype.



Validations :

  • Les modules seront validés par la notation des cahiers de laboratoire, des oraux et la rédaction d'une revue et d'un article scientifique à partir des résultats obtenus.
  • Les étudiants ayant validé cet enseignement  obtiendront le Diplôme de l’Institut Pasteur
  • Cet enseignement peut être validé pour l'obtention d'un Diplôme Universitaire (Universités Pierre et Marie Curie et Paris-Diderot) et de Crédits de Masters (2ème année) des universités Paris-Descartes, Pierre et Marie Curie et Paris-Diderot, pour les étudiants inscrits dans ces établissements. 

Plein temps, du 03 septembre au 31 octobre 2012 (examens inclus)

Nombre d’élèves : 24

Clôture des inscriptions : 22 juin 2012

Inscription en ligne : cliquez ici

Frais de participation

 


Membres du Comité du Cours :

C. Le Bouguénec (Institut Pasteur), C. Beloin (Institut Pasteur), C. Parsot (Institut Pasteur), E. Coeffier (Institut Pasteur), A. Klier et Isabelle Verstraete-Martin (Université Paris-Diderot), X. Nassif (Université Paris-Descartes) et G. Sezonov (Université P. et M. Curie).

* Représentants des Universités

Conférenciers (cours 2011) :

H. Bierne, I. Boneca, C. Bordi, C. Brochier-Armanet, J. Doré, E. Carniel, C. Citti,  L. Debarbieux, J. Enninga, P. Forterre, S. Gaudriault, N. Guiso-Maclouf,  P. Horvath, J-F. Humbert, I. Kansau, L. Kurz, D. Larzul, J-C. Manuguerra, R. Menard, O. Neyrolles, F. Norel-Bozouklian, C. Poyart, H. de Reuse, E. Rocha, C. Werts, J-R. Zahar.