Denis MESTIVIER

Modélisation des systèmes biologiques

Abstract: La biologie, soumise à la pression des données massives acquises dans différents domaines (les « -omics »), se doit d’intégrer de plus en plus d’informations hétérogènes pour comprendre un phénomène. Ainsi, elle est de plus en plus demandeuse de méthodologies de modélisation de grands systèmes biologiques. Nous présenterons un formalisme développé au laboratoire en collaboration avec une équipe de biologistes. Ce formalisme utilise une représentation booléenne adossée à une simulation évènementielle. Nous illustrerons comment ce formalisme permet de modéliser à la fois un grand réseau d’interactions cellulaire hétérogènes (comportant régulation génétique, métabolisme, transport, etc) dans l’étude de l’homéostasie du fer chez la levure (plus de 600 espèces [Achcar et al. 2011]), mais aussi à un niveau physiologique dans le cadre de la modélisation de l’homéostasie du fer chez l’homme.

Updated on 06/02/2014

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