Le génome de Listeria monocytogenes, bactérie responsable de graves infections alimentaires, par exemple à l'origine d'une épidémie sévissant actuellement en France, a été entièrement séquencé par un consortium européen coordonné à l'Institut Pasteur. Pascale Cossart, coordinatrice du projet, et Philippe Glaser, coordinateur des analyses et annotations de la séquence génomique, détailleront leurs avancées au cours du colloque Génomes 2000 qui se tient actuellement à l'Institut Pasteur à Paris. Le génome d'une autre espèce de Listeria, non pathogène, est actuellement séquencé par le laboratoire de Génomique des Micro-organismes Pathogènes à l'Institut Pasteur, avec pour but la comparaison de la bactérie pathogène et de sa " cousine " non virulente. Ceci devrait fournir des informations cruciales sur la Listeria et la listériose qui menacent périodiquement notre santé.
Listeria monocytogenes est responsable d'une grave infection alimentaire : la listériose, mortelle dans 20 à 30% des cas. Cette bactérie peut provoquer septicémies, infections du système nerveux central et avortements, et touche préférentiellement des personnes à risque (nouveaux-nés, femmes enceintes, personnes immunodéprimées et personnes âgées). La listériose peut se manifester de façon sporadique (environ 200 à 300 cas/an en France), mais elle peut aussi évoluer sous forme d'épidémies, comme celle survenue dernièrement en France (9 morts) et dont l'aliment responsable est activement recherché par les services du ministère de l'Agriculture et de la Répression des fraudes en collaboration avec le Centre National de Référence des Listeria à l'Institut Pasteur. Responsable de plusieurs centaines de cas chez l'homme dans les pays industrialisés, L. monocytogenes est donc à la fois un problème de santé publique et un problème économique pour les industries agro-alimentaires : régulièrement des denrées alimentaires (fromages, charcuteries, ) doivent être retirées de la vente en raison d'une contamination par cette bactérie.
Le consortium européen, coordonné par Pascale Cossart,
Chef de l'Unité des Interactions Bactéries-Cellules à
l'Institut Pasteur, qui a entrepris fin 1998 le séquençage
de l'intégralité du génome de Listeria monocytogenes,
regroupe 10 laboratoires et sociétés (voir liste en annexe).
Philippe Glaser, co-directeur du Laboratoire
de Génomique des Micro-organismes Pathogènes (GMP) coordonne
pour sa part l'analyse et l'annotation - en cours - de cette séquence
génomique, en collaboration avec le Service
d'Informatique Scientifique de l'Institut Pasteur. Ce projet a été
financé par la Communauté Européenne. Le séquençage
du génome de Listeria innocua, presque achevé, est
quant à lui réalisé par le seul GMP, et financé
par l'Institut Pasteur.
La connaissance des deux génomes va permettre une analyse comparative
entre une Listeria pathogène et une Listeria non-pathogène,
déjà engagée par les deux équipes pasteuriennes.
Cette comparaison devrait aboutir à l'identification de nouveaux
déterminants génétiques impliqués dans la pathogénicité
de L. monocytogenes et à l'amélioration des recherches
sur le mode d'action des gènes de virulence déjà connus.
Un programme de génomique comparative plus vaste a débuté
en collaboration avec le Laboratoire des Listeria de l'Institut Pasteur,
dirigé par Jocelyne Rocourt : il devrait aider à établir
les caractéristiques des souches de L. monocytogenes responsables
d'épidémies, et permettre de développer de nouveaux
outils de diagnostic et de typage moléculaire.
- Pascale COSSART, Chef de l'Unité des Interactions Bactéries-Cellules,
I.P.
Tél : 01 45 68 88 41 - E-mail : pcossart@pasteur.fr
- Philippe GLASER, co-responsable du Laboratoire de Génomique
des Micro-organismes Pathogènes, I.P.
Tél : 01 45 68 89 96 - E-mail : pglaser@pasteur.fr
http://www.pasteur.fr/recherche/unites/gmp/
- Bureau de presse de l'Institut Pasteur
Tél : 01 45 68 81 46 - E-mail : presse@pasteur.fr
http://www.actu/presse/infos/
GENOMES 2000, Conférence Internationale sur les Génomes Microbiens et les Génomes Modèles, 11-15 avril 2000, Institut Pasteur.
Coordination, Institut Pasteur, Paris, France :
Prof. Pascale Cossart
Unité des Interactions Bactéries-Cellules
Dr. Philippe Glaser
Laboratoire de Génomique des Microorganismes Pathogènes
Prof. Werner Goebel
TBI-Biozentrum, Lehrstuhl fuer Mikrobiologie
Université de Würzburg,
Würzburg, Allemagne
Prof. Jose A. Vazquez-Boland
Microbiologia e Immunologia
Facultad de Veterinaria
Universidad Complutense
Madrid, Espagne
Prof. Trinad Chakraborty
Institute for Medical Microbiology
Giessen, Allemagne
Prof. Patrick Berche
Unité INSERM U411
Faculté de Médecine Necker-Enfants Malades
Paris, France
Prof. Fernando Baquero
Servicio de Microbiologia, Hospital Ramon y Cajal
Madrid, Espagne
Prof. Francisco Garcia-del Portillo
Centro de Biologia Molecular " Severo Ochoa "
Universidad Autonoma de Madrid
Madrid, Espagne
Prof. Jürgen Wehland
GBF- Braunschweig
Dpt. Cellbiology and Immunology
Allemagne
Prof. Karl Dieter ENTIAN
Scientific Research and development GmbH (SRD)
Frankfurt/Maine, Allemagne